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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000676`

染色体: Chr07 坐标: 4605649-4606080 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000676`
名称	SmilChr07G000676
描述	SEED MATURATION PROTEIN 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4605649 - 4606080 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991940`
GeneID	`130991940`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991940`
原始查询	`LOC130991940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SEED MATURATION PROTEIN 1
产物	SEED MATURATION PROTEIN 1
Arabidopsis	`AT3G12960` (SMP1) seed maturation protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820482] identity=60; qcov=0.75; evalue=1.62e-19; confidence=low
Rice	`Os08g0104400` - identity=53.3; qcov=0.75; evalue=1.04e-15; confidence=low
GO	GO:0010162 (seed dormancy process)
KEGG	-
Pfam	PF27999 (SMP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991940

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772379.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057772379.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057772379.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057772379.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772379.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4605812`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B91
`Chr7:4605812`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B91
`Chr7:4605869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:4605910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C60
`Chr7:4605944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:4605955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772379.1

80 aa

SMP1

PF27999 SMP1 1-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772379.1`	Pfam	`PF27999`	SMP1	Family	1	61	1.6e-29	102.4	SEED MATURATION PROTEIN 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916396.1
AACTATATTAAGTGAATATTTGAAAATATAGTCTAACACACATGGCGCAGAGCAAGGACGACATAAAATACGGCACAGCTCAGGCGAAAGTATCGCCGGATGAATCTCTCAGAGTTGCCTACACCGGAGGCACGCCCCTCGAGGCCGGAAAAATTGCCGATTCCGAATTCGTCGACCTTTTCCCCGGCGCTCGTAAAATCTCCGACCAACACCATCAAGCCGACAGAGCTCGAGCAACACAGGAGCAAGATGGAGTCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991940
ATGGCGCAGAGCAAGGACGACATAAAATACGGCACAGCTCAGGCGAAAGTATCGCCGGATGAATCTCTCAGAGTTGCCTACACCGGAGGCACGCCCCTCGAGGCCGGAAAAATTGCCGATTCCGAATTCGTCGACCTTTTCCCCGGCGCTCGTAAAATCTCCGACCAACACCATCAAGCCGACAGAGCTCGAGCAACACAGGAGCAAGATGGAGTCTCGAGTCGGGATGATAATCGCCATTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772379.1
MAQSKDDIKYGTAQAKVSPDESLRVAYTGGTPLEAGKIADSEFVDLFPGARKISDQHHQADRARATQEQDGVSSRDDNRH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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