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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000795`

染色体: Chr07 坐标: 5616209-5617511 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000795`
名称	SmilChr07G000795
描述	uncharacterized SmilChr07G000795
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5616209 - 5617511 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991966`
GeneID	`130991966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991966`
原始查询	`LOC130991966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823807]; symbol=AT3G46540; hit=AT3G46540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823807]; symbol=AT3G46540; hit=AT3G46540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G46540` (AT3G46540) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823807] identity=69; qcov=0.935; evalue=2.18e-74; confidence=high
Rice	`Os01g0841000` (P0408C03.31-1) - identity=58.7; qcov=0.962; evalue=1.17e-68; confidence=high
GO	GO:0005543 (phospholipid binding); GO:0005768 (endosome); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006897 (endocytosis); GO:0030125 (clathrin vesicle coat); GO:0030276 (clathrin binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01417 (ENTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772383.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772383.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772383.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772383.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772383.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5616680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B2,B78,C63,C8
`Chr7:5616699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:5616717`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B52,B6,B76,B98,C21,C55,C70,C79,C8,C87
`Chr7:5616721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B140,C48,C63
`Chr7:5616724`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	B134,B138,B14,B18,B2,B23,B38,B39,B65,B78,B85,B97,B99,C3,C34,C5,C54,C8,C81
`Chr7:5616728`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr7:5616728`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr7:5616733`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B121,B52,B6,B98,C21,C55,C68,C70,C79,C8,C87
`Chr7:5616743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B8,B93
`Chr7:5616758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr7:5616789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B46,C78
`Chr7:5616805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C28,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772383.1

186 aa

186

ENTH

PF01417 ENTH 35-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772383.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	35	155	4.7e-29	101.7	ENTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916400.1
TTAAGAAAATATATAGGTAGGATGATATGAACAAAAATGTCAATGGTAAGAAGCAGTACTCAACATGAATCCAACACCTACACCTACATTTCATGAATTGAAGAAACAAGCTTCATTTTTCCTCAAGGAGAAGATCAAAACTGCACGATTGGCCCTCACCGATGTCACACCAGCACAACTATTTACCGAAGAAGCCACGGACGGGAATCCGGGCTGCCCGGATGCCCGGGCTCTGAAGCTCATATCCAAAGCCGCTTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991966
ATGAATCCAACACCTACACCTACATTTCATGAATTGAAGAAACAAGCTTCATTTTTCCTCAAGGAGAAGATCAAAACTGCACGATTGGCCCTCACCGATGTCACACCAGCACAACTATTTACCGAAGAAGCCACGGACGGGAATCCGGGCTGCCCGGATGCCCGGGCTCTGAAGCTCATATCCAAAGCCGCTTTCGAAGTTGACGATTATTGGAGAATTGTCCAAATTTTGCACAAAAGATTGGTAAGTTTTGATAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772383.1
MNPTPTPTFHELKKQASFFLKEKIKTARLALTDVTPAQLFTEEATDGNPGCPDARALKLISKAAFEVDDYWRIVQILHKRLVSFDKRKWRASYNALIVLEHLLXHGPQSVAQEFQNQTDVIAEMGRFQHIDEKGFNWGLNVRRKCERILSLLEKGPLLKEEREKARNKISRGIEGFGSFCLRTSST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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