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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003317`

染色体: Chr01 坐标: 51893377-51895680 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003317`
名称	SmilChr01G003317
描述	transcription factor bHLH87
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51893377 - 51895680 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991972`
GeneID	`130991972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991972`
原始查询	`LOC130991972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH87
产物	transcription factor bHLH87
Arabidopsis	`AT3G21330` (AT3G21330) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821687] identity=45.2; qcov=0.844; evalue=2.12e-75; confidence=high
Rice	`Os01g0707500` (OsbHLH118) - identity=66.4; qcov=0.304; evalue=4.56e-48; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF23173 (bHLH_SAC51)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991972

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772393.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772393.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772393.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772393.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772393.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51894497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:51894519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:51894568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C80
`Chr1:51894573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:51894610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:51894772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A13,B100,B106,B109,B112,B115,B12,B127,B20,B35,B5,B65,B78,B79,B82,C10,C20,C22,C35,C4,C40,C50,C54,C69,D1
`Chr1:51894827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr1:51894870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:51895055`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr1:51895055`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr1:51895086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:51895119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B118,B68,C42,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772393.1

411 aa

206

411

HLH

bHLH_SAC51

PF00010 HLH 313-354 aa PF23173 bHLH_SAC51 315-356 aa

XP_057772401.1

411 aa

206

411

HLH

bHLH_SAC51

PF00010 HLH 313-354 aa PF23173 bHLH_SAC51 315-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772393.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	313	354	3.2e-07	30.8	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057772393.1`	Pfam	`PF23173`	bHLH_SAC51	Domain	315	356	2e-10	41.1	Transcription factor SAC51 bHLH domain
`XP_057772401.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	313	354	3.2e-07	30.8	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057772401.1`	Pfam	`PF23173`	bHLH_SAC51	Domain	315	356	2e-10	41.1	Transcription factor SAC51 bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916410.1
AGCGCATGGCAAAACAGCAGCAGCCAAAAGGAAGCTCAGAGCTTTCCCCACTTCATTTAAATATTTTACAAAATTACTTTATAAAATTTCAGCTATAAATTAAACTTCAAAAAGATTACTTTTTATTTTTTATTTTTCTGTCTCTCAAATCTCATGCTCATATGCAGAATTCACTTCTTAGTTCTTACCACCCCACCAAACTGAGCAGAAAGCCTTATCTTTTTGAAAAACCATTCGCATCTTCTGTCAAATGTCATTTT...

XM_057916418.1
TATGTATCTCCAAATTAAATCGATTCTTCTTATTTCCGTCGCGTATTTACTGTTTTTTGGCCTTATCGTCTTTGTAAGCTATTGAGCAGTTACATGAATTTCTGCTTTTGTCTCGATTTCGACAAAATTTTGCAGCTGATAACTGACGTTAGCAATGGCTTGTTTTCTTGAAGGTCTTCACTTTCCTCAATTTATAAGCTAATTAAAAGGTTGTTGGAGCGCTGGTGCTTAAAACTACAATCAATATCTCTCTTCGATAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991972
ATGGATAATATTGATTGGGGCAATGAGCTTGAAGAAAGTTTTATAATGTCCAGCTCAATCAGCCTTCCCTACTACAACAACAACAAGATTGAGACGATTTCGTCGAAATTAGATACATACAGTCCAGTTCATCAGCAGATGCAGAAAACGGAGATATTATCCAATATTTTGCCTCAGCAATGGAATTCAAGATCAGGAGCTGGCAGCGGGTGGGGAGTCGCTATCAATGCAGGAGCGACGACGTCGGGCTCATTCATTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772393.1
MDNIDWGNELEESFIMSSSISLPYYNNNKIETISSKLDTYSPVHQQMQKTEILSNILPQQWNSRSGAGSGWGVAINAGATTSGSFIECSRPSALNTTPPLKNSIIDDSNVLEQHPPMAANAAASFESLDCLLSASTTDTTTSADQDDGISLIFSDCQNLWNFAKSGKTTITPVSRNSEEIVNNRSKRKREEAATSEPIGLTELDFQSNYSDHGNGSGGFQIISENQQKSTKKARLDPKQPLPVINSSSSNINFQQPSSSA...

XP_057772401.1
MDNIDWGNELEESFIMSSSISLPYYNNNKIETISSKLDTYSPVHQQMQKTEILSNILPQQWNSRSGAGSGWGVAINAGATTSGSFIECSRPSALNTTPPLKNSIIDDSNVLEQHPPMAANAAASFESLDCLLSASTTDTTTSADQDDGISLIFSDCQNLWNFAKSGKTTITPVSRNSEEIVNNRSKRKREEAATSEPIGLTELDFQSNYSDHGNGSGGFQIISENQQKSTKKARLDPKQPLPVINSSSSNINFQQPSSSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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