当前解析结果
SmilChr07G000806| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000806 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000806 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000806 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 5662205 - 5666764 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991974 |
|---|---|
| GeneID | 130991974 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991974 |
| 原始查询 | LOC130991974 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF27723 (UCP022260) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991974 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772390.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057772391.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772390.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772390.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057772390.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:5662705 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr7:5663390 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr7:5663402 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr7:5663409 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr7:5663411 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:5665672 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr7:5665868 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr7:5666188 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,B8 |
Chr7:5666385 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B80,C4,D5 |
Chr7:5666483 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A5,B67,C38,C51 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772390.1PF27723
UCP022260 198-250 aa
XP_057772391.1PF27723
UCP022260 198-234 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772390.1 |
Pfam | PF27723 |
UCP022260 | Family | 198 | 250 | 1.6e-16 | 61.1 | Uncharacterised conserved protein UCP022260 |
XP_057772391.1 |
Pfam | PF27723 |
UCP022260 | Family | 198 | 234 | 3.6e-08 | 33.6 | Uncharacterised conserved protein UCP022260 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。