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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000818`

染色体: Chr07 坐标: 5776622-5777873 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000818`
名称	SmilChr07G000818
描述	putative disease resistance protein RGA3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5776622 - 5777873 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991988`
GeneID	`130991988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991988`
原始查询	`LOC130991988`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA3
产物	putative disease resistance protein RGA3
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=49; qcov=0.271; evalue=3.22e-11; confidence=weak
Rice	`Os08g0543500` - identity=41.6; qcov=0.473; evalue=4.08e-14; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057772413.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057772413.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772413.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772413.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772413.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5777043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D5
`Chr7:5777048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C71,C73
`Chr7:5777170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,C80
`Chr7:5777498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B21,B91
`Chr7:5777506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:5777647`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B115,B15,C16,C54,C73
`Chr7:5777647`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B115,B15,C16,C54,C73
`Chr7:5777681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B64,C33,C37
`Chr7:5777704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B123
`Chr7:5777712`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	135	A10,A11,A15,A16,A18,A20,A22,A23,A7,B100,B101,B102,B104,B106,B108,B109,B110,B114,B115,B117,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B13,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B14,B140,B17,B19,B2,B20,B21,B23,B26,B27,B29,B30,B4,B40,B41,B45,B46,B48,B50,B53,B54,B56,B58,B59,B6,B63,B64,B66,B68,B71,B72,B73,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B88,B89,B95,B96,C10,C11,C14,C15,C18,C19,C21,C23,C24,C25,C28,C29,C30,C32,C34,C36,C37,C41,C42,C43,C44,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C74,C75,C76,C77,C78,C8,C82,C85,C86,C87,D1,D11,D2,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772413.1

188 aa

188

Rx_N

NB-ARC

PF18052 Rx_N 10-95 aa PF00931 NB-ARC 107-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772413.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	10	95	2.3e-23	82.8	Rx N-terminal domain
`XP_057772413.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	107	164	9.5e-15	55.3	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916430.1
TGGACATAGTGGTAGAGGTCCCTTTTGCAGCTTATTTGATTAAATCAATCATTTATAAAAATTTCTATAACCACTTGACGAGCCCAACGAAAACTTTGGCCCAAATCCAATTTCCTCTACCACAGACTACTCTTCGTTCCCCAAATCTTCGAGCTTTGATTCCATTCCATGTAGATAGAGATTAGAGAGAATGTTTGAATGGTCATCCTCAACTTTACAATAATTCATCTTCACACACACAAAAATTAATTAAAAATAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991988
ATGGATGGAGGAGGTGTGTCTGCCGCCGCCATAGAAGTTCTTGTTCAAAACGTCATCAACGTTTTCAAAGAAGAGCGGTCTCTACTTCGAGGTCTCGATGGAGATGCCCAACAGCTGCAGAGGACTCTGGGCATGATTCAAGCTTACTTGAATGACGCTGAGAAGAAATCAATCACCCAAGATGCAGTCAAGATCTGGTTGAGGGAGCTTGAAGCTGTGGCTTTCGATGCTGATAATGTTGTGGATGAACTCAGCTATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772413.1
MDGGGVSAAAIEVLVQNVINVFKEERSLLRGLDGDAQQLQRTLGMIQAYLNDAEKKSITQDAVKIWLRELEAVAFDADNVVDELSYHLLHKRVNKMKTPKDKISPEERTFSTLAIVGMGGMGKTTLTRKIFNHQRVKNRFGSRVWVHVSQNFDPMLLFKKIDRCIKIMTLSSEPYSNKEGRSQKDNSH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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