当前解析结果
SmilChr07G000822| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000822 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000822 |
| 描述 | UDP-glucose iridoid glucosyltransferase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 5795254 - 5796876 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991991 |
|---|---|
| GeneID | 130991991 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991991 |
| 原始查询 | LOC130991991 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glucose iridoid glucosyltransferase-like |
| 产物 | UDP-glucose iridoid glucosyltransferase-like |
| Arabidopsis | AT3G46670 (UGT76E11)UDP-glucosyl transferase 76E11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823820] identity=42.2; qcov=1.01; evalue=1.77e-124; confidence=medium |
| Rice | Os07g0241500 (OsUGT710C2)- identity=41.7; qcov=1.04; evalue=9.31e-107; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991991 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057772417.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057772417.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772417.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772417.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772417.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:5795457 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C46 |
Chr7:5795488 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
Chr7:5795517 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr7:5795520 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,B34 |
Chr7:5795522 |
G |
GCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B115,B20 |
Chr7:5795522 |
G |
GCT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B115,B20 |
Chr7:5795604 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr7:5795614 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,B72 |
Chr7:5795617 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,B34 |
Chr7:5795689 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A9,D9 |
Chr7:5795691 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B10,B34 |
Chr7:5795692 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772417.1PF00201
UDPGT 261-406 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772417.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 261 | 406 | 5.5e-32 | 112.0 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。