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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000830`

染色体: Chr07 坐标: 5884991-5889362 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000830`
名称	SmilChr07G000830
描述	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5884991 - 5889362 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991998`
GeneID	`130991998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991998`
原始查询	`LOC130991998`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1
产物	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1
Arabidopsis	`AT5G58960` (GIL1) glucose-6-phosphate isomerase, putative (DUF641) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836013] identity=57.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0825600` (OJ1111_B11.17) - identity=49.5; qcov=0.742; evalue=7.42e-122; confidence=high
GO	GO:0009639 (response to red or far red light); GO:0009959 (negative gravitropism)
KEGG	-
Pfam	PF04859 (DUF641); PF24994 (GIL1_IRKI_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772429.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772429.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772429.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772429.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772429.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5885332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:5885512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B72
`Chr7:5885651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,C35,C71,D2
`Chr7:5885677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:5887049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:5887058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B78
`Chr7:5887097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B122,C44
`Chr7:5887124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:5887130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:5887184`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr7:5887184`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr7:5887189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772429.1

547 aa

274

547

DUF641

GIL1_IRKI_C

PF04859 DUF641 145-262 aa PF24994 GIL1_IRKI_C 487-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772429.1`	Pfam	`PF04859`	DUF641	Family	145	262	7.3e-35	120.8	Plant protein of unknown function (DUF641)
`XP_057772429.1`	Pfam	`PF24994`	GIL1_IRKI_C	Domain	487	542	1.5e-12	48.0	GIL1/IRKI C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916446.1
ATGCCTCACCGCCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGACTGTGTGTGTGTGGGTGTAAAAGCTATGCTCCCTGATATACTTCGACCATTTCGAAATGAGAAATCAAGGACGAGGAAAATACGGTGCAAAAGGAGTGAAGAAGAAATGCAGATTTATTCTGTGCCATTCCACAGAGATCGACCCCCCAAACACACCTCTTTAACATCCCACAATAATCACAGAAATCTCTCCAGAAACGATCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991998
ATGCTCCCTGATATACTTCGACCATTTCGAAATGAGAAATCAAGGACGAGGAAAATACGGTGCAAAAGGAGTGAAGAAGAAATGCAGATTTATTCTGTGCCATTCCACAGAGATCGACCCCCCAAACACACCTCTTTAACATCCCACAATAATCACAGAAATCTCTCCAGAAACGATCCAAACCTCAAGAGAATGAGCAGCAAAGTTTCCAATTTCTCCGATCTGATCCAGCGCGTCACCGCCTCCTGCCTCCTCCACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772429.1
MLPDILRPFRNEKSRTRKIRCKRSEEEMQIYSVPFHRDRPPKHTSLTSHNNHRNLSRNDPNLKRMSSKVSNFSDLIQRVTASCLLHPLSGISRPDDLSDAGDDEDDYQNAVDEEEEDFDEEEDDDDLKINPNWGGGEQPPPRIVEVEMLMSQVFDAVSVMKRAYVSLQEAHCPWDPDKMRIADVAVVAELRRVGLLRERFRRSVSGGGGGRGGRWGVGAATLREVVAPYEAAVEELKKEVKLKQAEIENLREKLKTATSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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