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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000832`

染色体: Chr07 坐标: 5918252-5920364 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000832`
名称	SmilChr07G000832
描述	50S ribosomal protein L4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5918252 - 5920364 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992003`
GeneID	`130992003`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992003`
原始查询	`LOC130992003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L4, chloroplastic
产物	50S ribosomal protein L4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G07320` (RPL4) ribosomal protein L4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837243] identity=70.8; qcov=0.768; evalue=1.17e-104; confidence=high
Rice	`Os03g0265400` - identity=67.4; qcov=0.796; evalue=1.08e-106; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00573 (Ribosomal_L4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992003

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772433.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772433.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772433.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772433.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772433.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5918678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr7:5918717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:5918759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C26
`Chr7:5920071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772433.1

285 aa

142

285

Ribosomal_L4

PF00573 Ribosomal_L4 70-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772433.1`	Pfam	`PF00573`	Ribosomal_L4	Family	70	250	3.4e-54	184.1	Ribosomal protein L4/L1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916450.1
CGACTTTACCTAACAATACACAGAAAGCGTTTGTTGGGAAAGTAAATTGAAAAAAGCTTGGCAACTCTCCAGTTTGCAGCTAAGGATAACAGGATAACATCTCTCTTCTCTCTTTCTCACTTGTTCAACAACAATGGCGACCGCATCGCCTTCATCAATCTCCTTCTTCTCCTCCTCCATTTTCCTCTCCACTCCCAACCCCTCCCCCAAAACCCTCCACTTCCCCCGCCTAAGGCCGCGCGCCGCCGCAATCCAGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992003
ATGGCGACCGCATCGCCTTCATCAATCTCCTTCTTCTCCTCCTCCATTTTCCTCTCCACTCCCAACCCCTCCCCCAAAACCCTCCACTTCCCCCGCCTAAGGCCGCGCGCCGCCGCAATCCAGGCGGAGCTGGCCACAGTCCCCGTGCTCTCCTTCGAAGGCAACCAGGTGGGAACCACCACCCTCAACTTAAAATCCGCGCCCCCGGAGACCGCGCGCTCCGTCGTCCACCGCGGCATCACCACCGACCTCACCAACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772433.1
MATASPSSISFFSSSIFLSTPNPSPKTLHFPRLRPRAAAIQAELATVPVLSFEGNQVGTTTLNLKSAPPETARSVVHRGITTDLTNRRRGTASTLTRAEVRGGGRKPYPQKKTGGARRGSQRTPLRPGGGVIFGPKPKDWSIKINRKEKRLAISTAIASALQNTIVVEDLEEKFEKPKTKEFIALMKRLGLDPKRKSMFLMTEVPDSLRLSSRNVGTLKMLTPRTLNLFDILDAESLVLTKGAVDFLNERYGLDEDDEDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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