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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000843`

染色体: Chr07 坐标: 6009023-6013361 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000843`
名称	SmilChr07G000843
描述	probable anion transporter 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6009023 - 6013361 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992015`
GeneID	`130992015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992015`
原始查询	`LOC130992015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable anion transporter 4, chloroplastic
产物	probable anion transporter 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G46980` (PHT4;3) phosphate transporter 4;3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823851] identity=74.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0852200` (PHT4;3) probable anion transporter 3, chloroplastic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4324813] identity=70.2; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005315 (phosphate transmembrane transporter activity); GO:0009536 (plastid); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772452.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057772452.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057772453.1`
4	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057772453.1`
5	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.60000	`XP_057772453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6009043`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr7:6009043`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr7:6009045`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr7:6009045`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr7:6009055`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A20,C2,C36
`Chr7:6009055`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A20,C2,C36
`Chr7:6009166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B103,C86
`Chr7:6009183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	134	A1,A11,A15,A16,A18,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B102,B104,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B115,B118,B119,B121,B123,B124,B125,B128,B13,B130,B131,B133,B135,B136,B138,B139,B14,B15,B16,B18,B21,B22,B23,B24,B28,B29,B3,B30,B31,B35,B37,B38,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B50,B52,B57,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B7,B72,B75,B76,B77,B78,B80,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B99,C1,C10,C11,C13,C19,C2,C20,C22,C25,C31,C33,C35,C36,C37,C4,C40,C41,C47,C49,C50,C52,C53,C56,C59,C61,C62,C67,C69,C71,C72,C73,C76,C77,C78,C80,C81,C83,C85,C9,D1,D2,D3,D4,D9
`Chr7:6009252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C9
`Chr7:6009285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:6009320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B124,B136,B18,B61
`Chr7:6009417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C5,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772452.1

568 aa

284

568

MFS_1

PF07690 MFS_1 151-521 aa

XP_057772453.1

355 aa

178

355

MFS_1

PF07690 MFS_1 1-308 aa

XP_057772454.1

355 aa

178

355

MFS_1

PF07690 MFS_1 1-308 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772452.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	151	521	1.8e-46	159.4	Major Facilitator Superfamily
`XP_057772453.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	1	308	7.3e-37	127.8	Major Facilitator Superfamily
`XP_057772454.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	1	308	7.3e-37	127.8	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916469.1
AGCGTGGATGCCCAAGAACGTATCAGTAAAAGGAAAATGGCGCTTGACAGAGAACTCTACTTCTAATTCTCTGCTCAACCCCCTCCTTCCATTTCCATACACCATTTTCTCTATCCACCAGTTGCCAACGATGAATTCCCATTCTCTCACTGCACTCAACCAGCGCCTCTGCTCGAGCTCAATTCCGCGCCGCCAAAACCCTAACGAGCACAGTATTTCTCACTGCGTCGGGTTTTCTTCGACATCCACGTCGATACGAA...

XM_057916470.1
CTTCGGAGAGGGTGAAGGTAGTGGCCATGCTTGCGCTGGCTTTGGCCCTCTGCAACGCCGATCGCGTCGTCATGTCGGTGGCTATCGTTCCGCTTTCGCTGTCGCGCGGTTGGGGTCCGTCTTTTTCCGGTGTTGTTCAGTTACTAATGGCAGTCATCTTTTCTATGGGGATATCTGATATCACCTATAGCTGGAGGGACTCTGGTGGATCATTATGGTGGTAAGGTGGTCATGGCTTGGGGGGTAGCTCTGTGGTCTCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992015
ATGCCCAAGAACGTATCAGTAAAAGGAAAATGGCGCTTGACAGAGAACTCTACTTCTAATTCTCTGCTCAACCCCCTCCTTCCATTTCCATACACCATTTTCTCTATCCACCAGTTGCCAACGATGAATTCCCATTCTCTCACTGCACTCAACCAGCGCCTCTGCTCGAGCTCAATTCCGCGCCGCCAAAACCCTAACGAGCACAGTATTTCTCACTGCGTCGGGTTTTCTTCGACATCCACGTCGATACGAAGGCTTGC...

LOC130992015
ATGGCTTGGGGGGTAGCTCTGTGGTCTCTGGCTACTTTCCTTACTCCTTGGGCAGCAGAATCATCTTTATTGGCTCTACTTGCAACACGGATGATGCTTGGTATTGCAGAAGGTGTAGCCCTTCCTTGCATGAATAATATGATAGCAAGATGGTTTCCTCAAACCGAAAGGTCAAGGGCTGTGGGACTTGCAATGGCTGGATTTCAGCTTGGAAGTGCTATTGGGCTTACACTTTCCCCCATCCTCATGTCACAGGCAGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057772452.1
MPKNVSVKGKWRLTENSTSNSLLNPLLPFPYTIFSIHQLPTMNSHSLTALNQRLCSSSIPRRQNPNEHSISHCVGFSSTSTSIRRLAPPSFNASAGGAAPFRLKIGGSGLNRLRSSSNDGQFLVSGSLDGSPEPSFVEFITSERVKVVAMLALALALCNADRVVMSVAIVPLSLSRGWGPSFSGVVQSSFLWGYLISPIAGGTLVDHYGGKVVMAWGVALWSLATFLTPWAAESSLLALLATRMMLGIAEGVALPCMNNM...

XP_057772453.1
MAWGVALWSLATFLTPWAAESSLLALLATRMMLGIAEGVALPCMNNMIARWFPQTERSRAVGLAMAGFQLGSAIGLTLSPILMSQAGIYGPFVIFGLFGFLWLLVWVSATSSSPDRSPQISKFELRYIQSRSSVPSLSKSRPETRKGIPPFRSLLSKLPTWSLIVANAMHSWGFFVILSWMPIYFKTIYHVDLRHAAWFSAIPWSMMALTGYLAGVLSDMMIQRGISVTLTRKIMQSIGFFGPGLALVCLTNARSPFVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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