当前解析结果
SmilChr07G000856| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000856 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000856 |
| 描述 | inositol 3-kinase |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 6099202 - 6102523 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992033 |
|---|---|
| GeneID | 130992033 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992033 |
| 原始查询 | LOC130992033 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | inositol 3-kinase |
| 产物 | inositol 3-kinase |
| Arabidopsis | AT5G58730 (Mik)pfkB-like carbohydrate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835987] identity=62.3; qcov=0.945; evalue=1.05e-117; confidence=high |
| Rice | Os03g0737701 (OsMIK)- identity=57.4; qcov=0.983; evalue=2.37e-100; confidence=high |
| GO | GO:0010264 (myo-inositol hexakisphosphate biosynthetic process); GO:0016301 (kinase activity) |
| KEGG | smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00294 (PfkB) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992033 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057772477.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057772477.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057772478.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772477.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772477.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:6099650 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B6,C63 |
Chr7:6099673 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B6,C63 |
Chr7:6099676 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,D11 |
Chr7:6099706 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr7:6099709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B6,C63 |
Chr7:6099713 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr7:6099759 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C15,C61,D6 |
Chr7:6099790 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr7:6099791 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B6,C63 |
Chr7:6099817 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B6,C63 |
Chr7:6099848 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:6099905 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C1,C48 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772477.1PF00294
PfkB 199-270 aa
XP_057772478.1PF00294
PfkB 199-270 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772477.1 |
Pfam | PF00294 |
PfkB | Domain | 199 | 270 | 1.9e-19 | 70.9 | pfkB family carbohydrate kinase |
XP_057772478.1 |
Pfam | PF00294 |
PfkB | Domain | 199 | 270 | 7.6e-20 | 72.2 | pfkB family carbohydrate kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。