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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000862`

染色体: Chr07 坐标: 6142368-6143992 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000862`
名称	SmilChr07G000862
描述	RING-H2 finger protein ATL63-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6142368 - 6143992 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992038`
GeneID	`130992038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992038`
原始查询	`LOC130992038`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL63-like
产物	RING-H2 finger protein ATL63-like
Arabidopsis	`AT3G16720` (ATL2) TOXICOS EN LEVADURA 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820924] identity=34.2; qcov=0.928; evalue=7.7e-26; confidence=low
Rice	`Os09g0468300` - identity=33.8; qcov=0.697; evalue=2.03e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057772483.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772483.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057772483.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057772483.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057772483.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6143175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:6143269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B81
`Chr7:6143295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:6143330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:6143344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:6143394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:6143413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:6143439`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A24,A3,A5,A7,A8,B101,B102,B104,B111,B112,B115,B122,B128,B136,B17,B20,B22,B23,B24,B25,B28,B33,B42,B43,B46,B48,B50,B53,B57,B66,B67,B68,B71,B77,B81,B87,B89,B94,C14,C16,C30,C33,C44,C5,C53,C58,C6,C60,C62,C7,C73,C76,C84,D11,D3,D5
`Chr7:6143444`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A24,A3,A5,A7,A8,B101,B102,B104,B111,B112,B115,B122,B128,B136,B17,B20,B22,B23,B24,B25,B28,B33,B42,B43,B46,B48,B50,B53,B57,B66,B67,B68,B71,B77,B81,B87,B89,B94,C14,C16,C30,C33,C44,C5,C53,C58,C6,C60,C62,C7,C73,C76,C84,D11,D3,D5
`Chr7:6143546`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	81	A10,A15,A18,A21,A23,A7,B103,B104,B105,B107,B11,B110,B112,B113,B118,B12,B121,B124,B126,B128,B13,B133,B138,B14,B140,B15,B16,B19,B2,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B34,B36,B38,B39,B4,B44,B47,B5,B50,B55,B59,B64,B72,B76,B80,B95,B98,C10,C13,C14,C15,C17,C22,C25,C27,C28,C34,C39,C40,C44,C48,C49,C53,C56,C58,C59,C61,C62,C76,C77,C80,C83,C85,D10,D2,D8
`Chr7:6143548`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	69	A10,A15,A18,A21,A23,A7,B103,B104,B107,B11,B110,B112,B118,B12,B121,B124,B126,B128,B13,B138,B14,B140,B15,B19,B2,B25,B26,B29,B31,B34,B36,B38,B39,B4,B44,B50,B64,B72,B76,B80,B98,C10,C13,C14,C15,C17,C22,C25,C28,C34,C39,C40,C44,C48,C49,C53,C56,C58,C59,C61,C62,C76,C77,C80,C83,C85,D10,D2,D8
`Chr7:6143553`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	71	A13,A18,A19,A20,A21,A22,A4,B1,B100,B101,B105,B108,B113,B119,B123,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B139,B16,B18,B21,B27,B28,B3,B30,B45,B47,B49,B5,B54,B55,B59,B67,B7,B74,B78,B79,B82,B93,B94,B95,C12,C23,C27,C29,C31,C36,C4,C41,C43,C45,C46,C5,C54,C57,C64,C65,C66,C70,C71,C72,C87,C9,D11,D4,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772483.1

195 aa

195

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

PF17123 zf-RING_11 100-129 aa PF13923 zf-C3HC4_2 100-142 aa PF13639 zf-RING_2 100-143 aa PF13445 zf-RING_UBOX 101-140 aa PF00097 zf-C3HC4 101-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772483.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	100	129	3.8e-10	40.0	RING-like zinc finger
`XP_057772483.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	100	142	8.1e-08	32.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057772483.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	100	143	6.8e-14	52.6	Ring finger domain
`XP_057772483.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	101	140	1.4e-05	25.7	RING-type zinc-finger
`XP_057772483.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	101	142	1.6e-05	25.4	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916500.1
TAATTTTTGGGAGCTATAAGGTCTTGGTGCTTATTTTTACAGTTTATAAGCTATTTGGAAACTTATTTTGTCAAACACTTTAAAGGAGCTTATAAGTTTTTAAACAATTTATAAATTGTTTTAAAGAGTTTATAAGCTCAGCCAAACACCTTGCGTCTGCATCTATTTTAGTGGTCTCAAATGTCTTGCTCGATGCACATTCATTGGCAGACTTGTATTAAGTCTAATCTAGCTTATATCTATATTATCAAGCTTTATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992038
ATGAATCTATCGCTCCAAATCATCATCTCACGCGGCGGCAACATGGCCGGAATCATGTCCGTGGCGATCCTGTCGTTGTTGGTGGTGTTCTTCTTCGTGGCCATGCTTCATTGCTATGCTAGATGGTGCATGGCGCCGCCGGCCGCCGTGGTGGGGTCCCACCGTTTACTCATCCTACGGCACCTGTTGAATATGGAGGGTGTCGTGGAGTGGGCCCCAGAGGCGCAGGGGCTCGACCCTCACGTTTTATCTTCTATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772483.1
MNLSLQIIISRGGNMAGIMSVAILSLLVVFFFVAMLHCYARWCMAPPAAVVGSHRLLILRHLLNMEGVVEWAPEAQGLDPHVLSSIPVFICEGEYCSGLECVICLSSFENGEEGKRLPLCGHAFHVGCINMWLHSHATCPVCRAPALLVVEDESNVEAVSLDVTRVSDELEIVVQVPGSEGGSGSNATHKAAFVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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