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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000866`

染色体: Chr07 坐标: 6181700-6188513 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000866`
名称	SmilChr07G000866
描述	uncharacterized SmilChr07G000866
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6181700 - 6188513 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992042`
GeneID	`130992042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992042`
原始查询	`LOC130992042`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHD finger transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835975]; symbol=AT5G58610; hit=AT5G58610; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PHD finger transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835975]; symbol=AT5G58610; hit=AT5G58610; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G58610` (AT5G58610) PHD finger transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835975] identity=40.7; qcov=0.548; evalue=2.84e-149; confidence=medium
Rice	`Os04g0433900` - identity=38.9; qcov=0.334; evalue=2.39e-83; confidence=low
GO	GO:0003714 (transcription corepressor activity); GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00583 (Acetyltransf_1); PF00628 (PHD); PF05641 (Agenet); PF16135 (TDBD); PF22970 (DUF7028); PF23011 (PHD-1st_NSD); PF23209 (IDM1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772487.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772487.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772487.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772487.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772487.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6182390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:6182449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C37
`Chr7:6182463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B129,B13,B37,C71
`Chr7:6182475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:6182919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D11
`Chr7:6183173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B20
`Chr7:6183272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A7,B72,D8
`Chr7:6183724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:6183728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:6183879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:6184387`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D7
`Chr7:6184387`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772487.1

1249 aa

624

1249

Agenet

DUF7028

TDBD

PHD-1st_NSD

PHD

IDM1_C

Acetyltransf_1

PF05641 Agenet 12-89 aa PF22970 DUF7028 359-435 aa PF22970 DUF7028 489-570 aa PF16135 TDBD 747-797 aa PF23011 PHD-1st_NSD 821-865 aa PF00628 PHD 826-865 aa PF23209 IDM1_C 985-1123 aa PF00583 Acetyltransf_1 1004-1080 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772487.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	12	89	2.3e-12	47.9	Agenet domain
`XP_057772487.1`	Pfam	`PF22970`	DUF7028	Domain	359	435	3.6e-47	158.9	Domain of unknown function (DUF7028)
`XP_057772487.1`	Pfam	`PF22970`	DUF7028	Domain	489	570	3.6e-47	158.9	Domain of unknown function (DUF7028)
`XP_057772487.1`	Pfam	`PF16135`	TDBD	Domain	747	797	9.4e-22	77.5	Tify domain binding domain
`XP_057772487.1`	Pfam	`PF23011`	PHD-1st_NSD	Domain	821	865	8.1e-08	33.0	Histone-lysine N-methyltransferase NSD-like, PHD zinc finger 1
`XP_057772487.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	826	865	9.5e-11	42.3	PHD-finger
`XP_057772487.1`	Pfam	`PF23209`	IDM1_C	Domain	985	1123	3e-56	190.1	Increased DNA methylation 1, C-terminal domain
`XP_057772487.1`	Pfam	`PF00583`	Acetyltransf_1	Family	1004	1080	2.2e-05	25.5	Acetyltransferase (GNAT) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091236.1
GGTTATTAAAGGTAACAAAAGCCATTTGCTGAAACGAAAACTCAAAAACCCCACGCTAAATGGCGGCCAGAGAGAGAAAGCTTCTTCTTCATGATAAAGTTGAGGTGAGGAGCGTTGAGGATGGGTTTGTGGGTTCATGGCACCCTGGTGTGGTAATTGGCTGCAAAGAATTGGTTCGTGTAGTTGAGTATGATCTCATTCTATGTGATGATGGCTCTGCTAAGCTGGTCGAGGATGTGGAGGTGACCACTGCAATTGAT...

XM_057916504.1
GGTTATTAAAGGTAACAAAAGCCATTTGCTGAAACGAAAACTCAAAAACCCCACGCTAAATGGCGGCCAGAGAGAGAAAGCTTCTTCTTCATGATAAAGTTGAGGTGAGGAGCGTTGAGGATGGGTTTGTGGGTTCATGGCACCCTGGTGTGGTAATTGGCTGCAAAGAATTGGTTCGTGTAGTTGAGTATGATCTCATTCTATGTGATGATGGCTCTGCTAAGCTGGTCGAGGATGTGGAGGTGACCACTGCAATTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992042
ATGGCGGCCAGAGAGAGAAAGCTTCTTCTTCATGATAAAGTTGAGGTGAGGAGCGTTGAGGATGGGTTTGTGGGTTCATGGCACCCTGGTGTGGTAATTGGCTGCAAAGAATTGGTTCGTGTAGTTGAGTATGATCTCATTCTATGTGATGATGGCTCTGCTAAGCTGGTCGAGGATGTGGAGGTGACCACTGCAATTGATGGGGTTCTTGATAAAGAAGTTAAGAGGCCCAGTGAGTATAGGGGCTTGATTAGGCCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772487.1
MAARERKLLLHDKVEVRSVEDGFVGSWHPGVVIGCKELVRVVEYDLILCDDGSAKLVEDVEVTTAIDGVLDKEVKRPSEYRGLIRPSPESLLLGVEGARSLHYGACVDLFYDDAWWEGVVFDHEDGCERRRIFFPDLGDEVEGKVDNLRLSKDWDEVTEEWKSRGNWLFLELIEELEQDFPLIVSVKQIWYDVRTKDDFGKLGEWTSSKRDVWKKIMLQVFYDNLKLAVKQIFENVNSSLKPGKTGQTLLKFPEKDFESI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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