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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000873`

染色体: Chr07 坐标: 6250304-6253305 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000873`
名称	SmilChr07G000873
描述	uncharacterized SmilChr07G000873
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6250304 - 6253305 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992047`
GeneID	`130992047`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992047`
原始查询	`LOC130992047`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835965]; symbol=AT5G58520; hit=AT5G58520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835965]; symbol=AT5G58520; hit=AT5G58520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G58520` (AT5G58520) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835965] identity=64.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0295600` - identity=55.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF24093 (DUF7377)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992047

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772492.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057772492.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057772492.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772492.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772492.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6250649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B140
`Chr7:6250673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:6250708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr7:6250789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:6250810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:6250829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:6250855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:6250857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B53,B71,C77,C81
`Chr7:6250878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:6250893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B119,B56,B82,C16,C30
`Chr7:6250893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B56,B82,C16,C30
`Chr7:6250911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B31,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772492.1

600 aa

300

600

DUF7377

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF24093 DUF7377 144-255 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 374-588 aa PF00069 Pkinase 377-585 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772492.1`	Pfam	`PF24093`	DUF7377	Domain	144	255	2.3e-55	186.0	Domain of unknown function (DUF7377)
`XP_057772492.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	374	588	1.7e-39	136.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057772492.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	377	585	3.7e-27	96.1	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916509.1
ATAGTAATGTATGCCAAGTATTCTTCTACAGTCATCGCTATATTTAAAACTTGGTGATAATCGTTAAAAGGTGGAGTATTTTAGTAGTAGTATTTTCTATCTTTTTGATTCAATAAATATAAGTATAGCAGCATATGATTCATGTCAGACCGAAAAGGAGAAATTGAAGCACCGTTTCAAGTCTCTCACATGTACTAATCTGCGCGATTCAAGCTAATCCGACTCTCTCTCTCTCACTCTGTCTTTCTCTCTCCTCCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992047
ATGGCAGCAGCTCTGGAGTGCTGGTCGAGCCGAACAAGCACGGACGAGGACATGGTGGAGCAAGTTCTGATGCGTACACACGATAGATCAGAATGCCTGCCGGAAAACAACTCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCGCCTCTTCGTCGACCCCTTCTTCCTCCGCCGCCGCCTCCGCCTCCGCCGCCGTGCGCGACTCCTCCGCCTTTCAGAAGCGGTTCCAGAGGCTGAGCCGCAACGTGTCGGAGGCCATTGCCTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772492.1
MAAALECWSSRTSTDEDMVEQVLMRTHDRSECLPENNSSSSSSSSASSSTPSSSAAASASAAVRDSSAFQKRFQRLSRNVSEAIASLKNTLNIDSAREPPATCRRQVWGSVVRSLTQLYPGSQLPEKLVSNLRKHYDSLPLSYAQAGFEMKDVFLHIKLIEQAAAEDNPAIIIQDVSDEDTSADGAAFKLTFACNSAISWPAMSGALDSLSICCKKLQIFEKKGCTLGIVVLIVQTGQEKMFKTRIENALRLASKKPKNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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