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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000877`

染色体: Chr07 坐标: 6270313-6274742 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000877`
名称	SmilChr07G000877
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 15b
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6270313 - 6274742 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992051`
GeneID	`130992051`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992051`
原始查询	`LOC130992051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 15b
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 15b
Arabidopsis	`AT5G58470` (TAF15b) TBP-associated factor 15B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835960] identity=57.8; qcov=0.805; evalue=2.22e-85; confidence=high
Rice	`Os01g0164400` - identity=70.7; qcov=0.367; evalue=1.54e-70; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992051

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772499.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057772499.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772499.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057772499.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772499.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6272087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C42,C48
`Chr7:6272676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C48,D11
`Chr7:6272748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:6272982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C71
`Chr7:6273038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr7:6273134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:6273177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr7:6273237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:6274378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:6274481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B114,B85,B99
`Chr7:6274495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr7:6274529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772499.1

450 aa

225

450

RRM_1

PF00076 RRM_1 312-341 aa

XP_057772500.1

447 aa

224

447

RRM_1

PF00076 RRM_1 309-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772499.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	312	341	1.8e-10	41.3	RNA recognition motif
`XP_057772500.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	309	338	1.7e-10	41.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091238.1
AATCCAAATCCAAAACAAAAATATCTGTATACCTTTAAAGAGTCTTCTGAGAGTGATTCCCTTAACCCTAGCTCATCTTCTTCAAGCCCCCTTTTTTCTGTGCTCTCACGCGAGGAATAAGCGGTCTGTTAATTTTAGGGAAATTTGATTTGGTTATCTCAGTTGACCTAGGAAGATGTCTGGTATGTACGGCCAAGAAGGCGACGGATCTGGCGCGCCGCCCATGGGCGGAAGCGGAGGTTATGGCGGTGGTGGATATG...

XR_009091239.1
AATCCAAATCCAAAACAAAAATATCTGTATACCTTTAAAGAGTCTTCTGAGAGTGATTCCCTTAACCCTAGCTCATCTTCTTCAAGCCCCCTTTTTTCTGTGCTCTCACGCGAGGAATAAGCGGTCTGTTAATTTTAGGGAAATTTGATTTGGTTATCTCAGTTGACCTAGGAAGATGTCTGGTATGTACGGCCAAGAAGGCGACGGATCTGGCGCGCCGCCCATGGGCGGAAGCGGAGGTTATGGCGGTGGTGGATATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992051
ATGTCTGGTATGTACGGCCAAGAAGGCGACGGATCTGGCGCGCCGCCCATGGGCGGAAGCGGAGGTTATGGCGGTGGTGGATATGGCGGTTCTGAAGGCGGAGGAGGCTACGGAGGTTATGGCGGCGGTGGAGGTGGAGGCTACGGGAATCGAGGAAGCGGTGGTGGAGGCTACGGTGGAAGAGGCGGAGGCGGTGGATACGGAGGGGGTGGAGGAGGTGGATACCCGGGTGATCGTGGCGGTGGGTACCAAGGGGATCG...

LOC130992051
ATGTCTGGTATGTACGGCCAAGAAGGCGACGGATCTGGCGCGCCGCCCATGGGCGGAAGCGGAGGTTATGGCGGTGGTGGATATGGCGGTTCTGAAGGCGGAGGAGGCTACGGAGGTTATGGCGGCGGTGGAGGTGGAGGCTACGGGAATCGAGGAAGCGGTGGTGGAGGCTACGGTGGAAGAGGCGGAGGCGGTGGATACGGAGGTAATAGAGGGGGTGGAGGAGGTGGATACCCGGGTGATCGTGGCGGTGGGTACCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772499.1
MSGMYGQEGDGSGAPPMGGSGGYGGGGYGGSEGGGGYGGYGGGGGGGYGNRGSGGGGYGGRGGGGGYGGNRGGGGGGYPGDRGGGYQGDRGGRGGGGGRGGGRGGGSGREGDWRCPNQSCGNVNFARRTECNKCGTQSPAGGDDRGGRGGGGGGQSRGGRGGGYENSRGGRGNYYDGGSGRSGNGYDGGSQGRDDGGYGQSPPIAPPSYGGAGGFAPPNAYGGNPNYAPDAVPPPTSYTGGPTSHPPSYGAPVGYGGDGQ...

XP_057772500.1
MSGMYGQEGDGSGAPPMGGSGGYGGGGYGGSEGGGGYGGYGGGGGGGYGNRGSGGGGYGGRGGGGGYGGGGGGGYPGDRGGGYQGDRGGRGGGGGRGGGRGGGSGREGDWRCPNQSCGNVNFARRTECNKCGTQSPAGGDDRGGRGGGGGGQSRGGRGGGYENSRGGRGNYYDGGSGRSGNGYDGGSQGRDDGGYGQSPPIAPPSYGGAGGFAPPNAYGGNPNYAPDAVPPPTSYTGGPTSHPPSYGAPVGYGGDGQGGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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