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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000890`

染色体: Chr07 坐标: 6379807-6384369 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000890`
名称	SmilChr07G000890
描述	sorting nexin 2B-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6379807 - 6384369 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992064`
GeneID	`130992064`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992064`
原始查询	`LOC130992064`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sorting nexin 2B-like
产物	sorting nexin 2B-like
Arabidopsis	`AT5G58440` (SNX2a) sorting nexin 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835957] identity=62.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0346100` - identity=64.1; qcov=0.76; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding)
KEGG	-
Pfam	PF00787 (PX); PF09325 (Vps5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992064

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057772519.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057772519.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057772519.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057772519.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057772519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6380133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B53
`Chr7:6380517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:6384091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B66,C6,C79,D9
`Chr7:6384103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:6384110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B52,C65,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772519.1

572 aa

286

572

Vps5

PF00787 PX 181-261 aa PF09325 Vps5 327-561 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772519.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	181	261	7.5e-18	65.6	PX domain
`XP_057772519.1`	Pfam	`PF09325`	Vps5	Domain	327	561	1.2e-17	65.1	Vps5 C terminal like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916536.1
CACCTACACACTCAAACTCAATTTTATTACGTCATTATCGTATTTATAATTTTCTCAACAAAATCTGAAGTTGTTGCTGCTGGACGAAGATGAAGTGAAAGGAAGTTCATCAACTCTTCTATCAGCTTTCATCTATTTGATTCGAATTCTTCTGCAGTCTGATCCAAATCCATAAATTGCAGATTCACAGAAGGAATAATGGGATCAGAGAAGAATCCTAAAGCAAATAATGCGGAAAAAGAAGAAGAACGAGAAGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992064
ATGGGATCAGAGAAGAATCCTAAAGCAAATAATGCGGAAAAAGAAGAAGAACGAGAAGAATTTCTTCACCCCCTTTCCGCAGATGATAAATTGCAAACCCTAACCCTCAATAGCGACGGCGAAGAAACCTTCAATGGAGAAGTCTCTACATCCAAATCCTATTCACATTACCGCAGTGCCATGACTACTCTTTCCTCCTCCACCGAGCAACCCCTTTTCCCTCCGCCGTCGGTCGCCACGAATCCCGCCGTCTCGGATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772519.1
MGSEKNPKANNAEKEEEREEFLHPLSADDKLQTLTLNSDGEETFNGEVSTSKSYSHYRSAMTTLSSSTEQPLFPPPSVATNPAVSDPLLFPSHNPSLDSPSYADMFHPFHERLPESNGNGEISGEDTVSSPLSQSSSSDYLRISVSDPQKEFEPSNSIVPGGNTYISYLIMTSTNIADYEESDFSVRRRFKDVVTLSDRLSEGYRGFFIPPRPDKSLVESQVMQKQEFVEQRRVELEKYLKRLARHPMIRKSDELRVFLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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