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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000900`

染色体: Chr07 坐标: 6456611-6460276 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000900`
名称	SmilChr07G000900
描述	putative tRNA pseudouridine synthase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6456611 - 6460276 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992075`
GeneID	`130992075`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992075`
原始查询	`LOC130992075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative tRNA pseudouridine synthase
产物	putative tRNA pseudouridine synthase
Arabidopsis	`AT2G30320` (AT2G30320) Pseudouridine synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817582] identity=54.4; qcov=1; evalue=1.13e-174; confidence=high
Rice	`Os03g0338600` - identity=54.1; qcov=0.917; evalue=1.8e-169; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0009982 (pseudouridine synthase activity); GO:0031119 (tRNA pseudouridine synthesis); GO:1990481 (mRNA pseudouridine synthesis)
KEGG	-
Pfam	PF01416 (PseudoU_synth_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992075

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057772530.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057772530.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057772530.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772530.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6456994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:6456999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D11
`Chr7:6457055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B13,B98,C48,C80
`Chr7:6457494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:6457519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B14,D11
`Chr7:6457576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:6457620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B14,D11
`Chr7:6457636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B14,D11
`Chr7:6457688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B14,D11
`Chr7:6457692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr7:6457693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B13,B98,C48,C80
`Chr7:6457715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772530.1

504 aa

252

504

PseudoU_synth_1

PF01416 PseudoU_synth_1 331-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772530.1`	Pfam	`PF01416`	PseudoU_synth_1	Domain	331	409	4.2e-11	44.0	tRNA pseudouridine synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916547.1
GTAAATAACAATGGCGTCTGCGAACTCATACTCGTTTCATCTCCACAGTTTCAGTAGCAATGGCGGTTTCCTTACTACGAATCCCCTTTTCTCCACTCTGGATTACATCGTTATTATCAAGAGGCTGCTCACGAAACTCATACGATTTCAAGCCCCTCAGAGTTACATCTTTCAGCTCCGCCGCCGCCGACGCAGAAGTTGGGTCGTCGGAGACTGCCCCAAAATGGGAATCTATTCGCAAAAAGAAAGTGGTAATGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992075
ATGGCGGTTTCCTTACTACGAATCCCCTTTTCTCCACTCTGGATTACATCGTTATTATCAAGAGGCTGCTCACGAAACTCATACGATTTCAAGCCCCTCAGAGTTACATCTTTCAGCTCCGCCGCCGCCGACGCAGAAGTTGGGTCGTCGGAGACTGCCCCAAAATGGGAATCTATTCGCAAAAAGAAAGTGGTAATGCGCGTTGGCTACGTGGGATCCGATTACAGAGGATTGCAAATTCAGAGAAATGAACCTGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772530.1
MAVSLLRIPFSPLWITSLLSRGCSRNSYDFKPLRVTSFSSAAADAEVGSSETAPKWESIRKKKVVMRVGYVGSDYRGLQIQRNEPDVATIEGELEKAIFKVGGIRDSNFGDFTKIRWARSSRTDKGVHSLATMIAFKMEIPEFAWNNDPNGIVLARYVNSHLPENIRVFSILPSQRSFDARRECNIRKYSYLLPADVIGVKDNSTAGEIDHHLSDFNGILNAFEGDHPFHNYTVRSKYRTRSPRRVSVKTSPSKMAKLSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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