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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000904`

染色体: Chr07 坐标: 6469444-6471904 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000904`
名称	SmilChr07G000904
描述	biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6469444 - 6471904 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992080`
GeneID	`130992080`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992080`
原始查询	`LOC130992080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1
产物	biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1
Arabidopsis	`AT2G30330` (BLOS1) GCN5L1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817583] identity=64.9; qcov=0.864; evalue=1.33e-52; confidence=high
Rice	`Os11g0112300` - identity=59.7; qcov=0.939; evalue=3.94e-51; confidence=high
GO	GO:0016197 (endosomal transport); GO:0031083 (BLOC-1 complex)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06320 (GCN5L1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992080

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057772535.1`
2	Spindle	Spindle	0.80000	`XP_057772535.1`
3	Spindle pole	Spindle pole	0.80000	`XP_057772535.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772535.1`
5	Centrosome	中心体	0.40000	`XP_057772535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6469970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B132,B85
`Chr7:6469970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B85
`Chr7:6470034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C58,C63
`Chr7:6470922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:6470965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr7:6470975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B97
`Chr7:6470975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr7:6471055`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr7:6471055`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772535.1

132 aa

132

GCN5L1

PF06320 GCN5L1 19-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772535.1`	Pfam	`PF06320`	GCN5L1	Family	19	131	2.1e-37	128.6	GCN5-like protein 1 (GCN5L1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091244.1
ATCGCATTTTGATTTATTTTAGTTGTGTTACCTATTTATCCGATTCGATTTTTTTTTTTTGCATATCTAACTCGGACCGGCCGGTTCGATCAACTCTCCCAAACCGCGACACCTAGGGCTCAATTGCACGACCAAATCCAGGTGATTGTTGTATGAAGCTCCATAAATGGAGCGATCGCATTATGTGGAGGCAGGGAGTCTGGAGGCGTCACTTCTTCAAATGATCGACGATCACAATCATGCTGCGATTGAGCTGCGAG...

XR_009091242.1
ATCGCATTTTGATTTATTTTAGTTGTGTTACCTATTTATCCGATTCGATTTTTTTTTTTTGCATATCTAACTCGGACCGGCCGGTTCGATCAACTCTCCCAAACCGCGACACCTAGGGCTCAATTGCACGACCAAATCCAGGTTGCCTCTCGTCGGCGTCGCCCCCTAATTCTATTCTTTATTTTCTTTAATTCATTTTCAATTCTGATTTTCTGATCAGGGTAAAATTTATGCATTGTGTTTTGGCTTTCTTTCTTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992080
ATGGAGCGATCGCATTATGTGGAGGCAGGGAGTCTGGAGGCGTCACTTCTTCAAATGATCGACGATCACAATCATGCTGCGATTGAGCTGCGAGAACTAACTGAGAAAGCGAAGAAAGAAGCTCTTCGGACTGCGATCCGTGTGGCGGATCAGCTTGTGAAGGTCGTTGATGGTGGTGTGCACGAGATCTTCATTAATGAAAAACGGATCAAGGTGGAAATTCAAGCATTGACAGCAACGATTATGCGATTCTCGAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772535.1
MERSHYVEAGSLEASLLQMIDDHNHAAIELRELTEKAKKEALRTAIRVADQLVKVVDGGVHEIFINEKRIKVEIQALTATIMRFSKQTDQWLAVSHAINTAVKEIGDFENWMKTMELDCKSISAAICNIHQT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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