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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000917`

染色体: Chr07 坐标: 6552277-6554134 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000917`
名称	SmilChr07G000917
描述	expansin-A4-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6552277 - 6554134 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992095`
GeneID	`130992095`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992095`
原始查询	`LOC130992095`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A4-like
产物	expansin-A4-like
Arabidopsis	`AT2G40610` (EXPA8) expansin A8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818656] identity=78.2; qcov=0.945; evalue=3.61e-140; confidence=high
Rice	`Os01g0823100` (OsEXP2) - identity=73.3; qcov=0.976; evalue=3.67e-139; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992095

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057772568.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057772568.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772568.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772568.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772568.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6552749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:6553417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,A4,C76
`Chr7:6553525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B43,B53,B75,C79
`Chr7:6553528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B43,B53,B75,C79
`Chr7:6553588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:6553812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B87,D5
`Chr7:6553812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,D5
`Chr7:6553855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:6553863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,B85,C81,D6
`Chr7:6553884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,B85,C81,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772568.1

253 aa

126

253

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 66-150 aa PF01357 Expansin_C 162-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772568.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	66	150	6.6e-22	78.3	Lytic transglycolase
`XP_057772568.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	162	239	3.5e-32	111.1	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916585.1
GTGGCCGGCTGTTAGCACCATCTTGTCTCCCTGCCACCTTTCCCCTTTTCTTCTAACATTTTGTTTTATTTTCAAAAAACATTAGTATATTAAAATCAGTGGGGTTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTATAAATACTTCCTACTTTGTCCCTTTATCCTCACTTTAACGAGCCTCCATCTCTCTTAAAACCGCAAGACTTTTCCTATCAAACAAACATATATCTGTGAAAAAATGGTTGCTAACTTAGTTTCTCTTGCTACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992095
ATGGTTGCTAACTTAGTTTCTCTTGCTACTATTTCTCTCTTCGCTCTACACATTCTTGGATTGAATGTTGCTATGGCTGATTATGGAGGGTGGCAAAACGCTCATGCCACCTTCTACGGCGGTGGCGATGCTGCCGGCACAATGGGAGGGGCGTGTGGATATGGCAACATGTACAGCCAAGGCTACGGCACCAACACCGCCGCATTGAGCACGGCTCTCTTCAACAACGGGCTGACGTGCGGGGCGTGCTACGAAATGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772568.1
MVANLVSLATISLFALHILGLNVAMADYGGWQNAHATFYGGGDAAGTMGGACGYGNMYSQGYGTNTAALSTALFNNGLTCGACYEMRCTGERRWCLPGTVTVTATNFCPPNFALPNNNGGWCNPPLQHFDMAQPAFLQIAQYHAGIVPVVFRRVACVKKGGIRFTINGHAYFNLVLISNVAGAGDVHALSIKGSKSGWQTMSRNWGQNWQGNSYLNGQALSFRVTTSDGRTLTAYNVAPANWQFGQTFQGGQF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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