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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000989`

染色体: Chr07 坐标: 7210167-7213128 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000989`
名称	SmilChr07G000989
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7210167 - 7213128 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992110`
GeneID	`130992110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992110`
原始查询	`LOC130992110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=26.6; qcov=1.01; evalue=1.22e-67; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=31.2; qcov=0.968; evalue=2.82e-84; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057772592.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772592.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772592.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772592.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7210373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C49,C83
`Chr7:7210383`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C83
`Chr7:7210383`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C83
`Chr7:7210409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B63,B86
`Chr7:7210596`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B105,B121,B15,B21,B31,B61,B69,B70,C20,C34,C38,C51,C56
`Chr7:7210639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B12
`Chr7:7210639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:7210672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	47	A20,A22,A25,A5,A8,B108,B109,B113,B120,B132,B18,B2,B3,B38,B39,B44,B46,B47,B54,B55,B58,B59,B65,B7,B71,B84,C11,C16,C18,C23,C24,C3,C30,C35,C38,C40,C51,C55,C57,C69,C75,C78,C81,C9,D1,D10,D9
`Chr7:7210676`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B53,C62
`Chr7:7210676`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B53,C62
`Chr7:7210680`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A20,B109,B65,C11,C30,C69,C75,C81
`Chr7:7210684`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A20,B109,B65,C11,C30,C69,C75,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772592.1

883 aa

442

883

NB-ARC

AAA_22

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 164-328 aa PF13401 AAA_22 177-265 aa PF23559 WHD_DRP 412-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772592.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	164	328	3.1e-44	151.3	NB-ARC domain
`XP_057772592.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	177	265	7.7e-07	30.2	AAA domain
`XP_057772592.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	412	481	1.7e-19	70.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916609.1
TATTTAGAAGCAAATACCCCTATTCTATTAATATGGAGCAGATCAAGGACCCAACCATTGACTTTTCATCATAGGATCCAGTGAAAACCAATTTGTTTCTACATTTGCTGAAACTTCAAAGATTAGAGGTTTAGAGATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTACTCTTATTAATCTTATGGAGGATATGCAGAATCATCCTCGCCTTTCCCCTTCTCTTGACAACAAACAGATCAAATCTCTTTCTAAAAAGGTCCATTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992110
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTACTCTTATTAATCTTATGGAGGATATGCAGAATCATCCTCGCCTTTCCCCTTCTCTTGACAACAAACAGATCAAATCTCTTTCTAAAAAGGTCCATTTCTTGCTTAATTTTATTGAGACATACAATTCCCATGGAGGCAGCAAAGAAGCCCAAGATTTGGAGAGAAGAATCGTATCTGCAGCTCAGGAGGCTGAAGATGTGATTGAATCCCGCATCGTGAATCAAATTCTTGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772592.1
MAAYAALVTLINLMEDMQNHPRLSPSLDNKQIKSLSKKVHFLLNFIETYNSHGGSKEAQDLERRIVSAAQEAEDVIESRIVNQILGDDDGETSPSFLLKKIKDARKKVVEKIQYKSRLEKVLEQMDCIKKKMMKIEMKDGMRDEPVLATSSRPRQTSMVGFEEELIQLMDVLTSQKSTRQIISIVGMGGAGKTTLTTNAFKNSLIEQHFDIRAWATVSQEYSARDILSQLLSHLGHSRDENDSELGEQLYKMLLGKRYLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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