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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000975`

染色体: Chr07 坐标: 7085983-7091316 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000975`
名称	SmilChr07G000975
描述	probable CoA ligase CCL7
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7085983 - 7091316 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992126`
GeneID	`130992126`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992126`
原始查询	`LOC130992126`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable CoA ligase CCL7
产物	probable CoA ligase CCL7
Arabidopsis	`AT4G05160` (AT4G05160) AMP-dependent synthetase and ligase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825864] identity=56.8; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0152400` (OsACS1) - identity=51.5; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016405 (CoA-ligase activity)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992126

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057772620.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772620.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772620.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772620.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772620.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7086131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B12,B55,C70
`Chr7:7086397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr7:7086521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B12,B55
`Chr7:7086734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:7086888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B53,C62
`Chr7:7086963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:7086995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:7086999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C37,C72,D10
`Chr7:7087018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr7:7090260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B86
`Chr7:7090293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,B99,C2,D11
`Chr7:7090309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772620.1

556 aa

278

556

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 42-415 aa PF13193 AMP-binding_C 466-541 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772620.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	42	415	3.2e-89	300.1	AMP-binding enzyme
`XP_057772620.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	466	541	3.8e-18	66.9	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916637.1
TCTACCTCTCTCTCTCTTACACACACACACACAGAATGTCTTCCACCCTTATCCATGGCAAAGACGATGGAATCTACAGATCTCCAAGGCCTCCCATTTCCCTACCCCAGGACCCCAACTTCTCCATGATCCCGTTCCTCTTCAGAAAACTCTCCTCCACCTCCACCTCCGCTGCCCTCATCGACTCTGAAACTGCCGAAACCCTAACATTTTCCGACCTCAAAACCCACGTTCTAAACCTCTCCCGCGCCCTCATCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992126
ATGTCTTCCACCCTTATCCATGGCAAAGACGATGGAATCTACAGATCTCCAAGGCCTCCCATTTCCCTACCCCAGGACCCCAACTTCTCCATGATCCCGTTCCTCTTCAGAAAACTCTCCTCCACCTCCACCTCCGCTGCCCTCATCGACTCTGAAACTGCCGAAACCCTAACATTTTCCGACCTCAAAACCCACGTTCTAAACCTCTCCCGCGCCCTCATCAACCTCAACCTCTCCAAAAACGACGTCGTCTTCCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772620.1
MSSTLIHGKDDGIYRSPRPPISLPQDPNFSMIPFLFRKLSSTSTSAALIDSETAETLTFSDLKTHVLNLSRALINLNLSKNDVVFLLSPNSILFPVAFLAVIAAGAGATTANPQYTTTELSKQIKDSNPKLIITTHELHNKIKHVNLPCIILDDINHTNHILHNSNKSSSHSKKSELHLYSDLITSTTTSDWPLPRVAQTDVAAILYSSGTTGTSKGVVLTHRNFMAAAMMTTSDQDSSGEGQNVFLCFTPMFHVMGLAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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