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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001014`

染色体: Chr07 坐标: 7367819-7371254 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001014`
名称	SmilChr07G001014
描述	probable polygalacturonase At1g80170
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7367819 - 7371254 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992137`
GeneID	`130992137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992137`
原始查询	`LOC130992137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase At1g80170
产物	probable polygalacturonase At1g80170
Arabidopsis	`AT1G80170` (AT1G80170) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844357] identity=56.4; qcov=0.891; evalue=5.92e-172; confidence=high
Rice	`Os05g0542800` (OsPGL9) - identity=48.4; qcov=0.849; evalue=2.02e-139; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057772644.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057772644.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057772644.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772644.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772644.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7368114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	53	A14,A22,A9,B108,B11,B114,B120,B127,B132,B135,B138,B139,B17,B18,B3,B30,B31,B47,B48,B5,B51,B52,B54,B55,B63,B64,B70,B74,B78,B83,B84,B88,B89,B98,C21,C23,C24,C31,C35,C36,C37,C4,C41,C50,C55,C56,C57,C67,C82,C9,D4,D5,D9
`Chr7:7368125`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A4,B110,C60,C70,C71,C72,C79,D7
`Chr7:7368163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C63
`Chr7:7368211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C11,C69
`Chr7:7368215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A21,B101
`Chr7:7368813`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B124,B68,C3
`Chr7:7368813`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B124,B68,C3
`Chr7:7369035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C42,D11
`Chr7:7369058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C63,D7
`Chr7:7369331`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C71
`Chr7:7369331`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C71
`Chr7:7369490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772644.1

450 aa

225

450

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 92-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772644.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	92	414	5.2e-94	315.7	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916661.1
AGATGAAATTAAGTTGGAGGCAGTCCGAATTGACACCACATAGATATATACAATAATGCTACGTTTCATCCGTTTATGAAATTAAGTGGTGGAGATGAAAACTGCTTCTTCTCCAAAAACCTTTTCTTTTTGTTTCAAATATTCTTTTCTTCACGTATTGTTCATCATCCTTTATTTTCTCTCAAACGCTGCAAAATCAAATGGTTTCGATCCCATAATTCAGCTCCCTTCATCTGGGCTCTCAAGAAACAGCAGCAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992137
ATGAAAACTGCTTCTTCTCCAAAAACCTTTTCTTTTTGTTTCAAATATTCTTTTCTTCACGTATTGTTCATCATCCTTTATTTTCTCTCAAACGCTGCAAAATCAAATGGTTTCGATCCCATAATTCAGCTCCCTTCATCTGGGCTCTCAAGAAACAGCAGCAGGCAAAAAACTGTAGTTCTAAATATTGATAAATTTGGTGCTAAAGGGGATGGAATCGCTGATGACAGCAAGATTCTGCAAGATGTTTGGAAGGTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772644.1
MKTASSPKTFSFCFKYSFLHVLFIILYFLSNAAKSNGFDPIIQLPSSGLSRNSSRQKTVVLNIDKFGAKGDGIADDSKILQDVWKVACSVSSSPAKIVIPSGNSYLVNPTNFGGPCKSNVTLRISGTVVAPRDPEVWDAFDALKWLYFHDVNDLTVEGGGVINGMGEKWWDQSCKRNKSHPCTNAPRAITFHKCNNLKIRDITLVDSQKNHMVFTNCRHVAASRLRVIAPSDSPNTDGVHISESTQVQLKDATIATGDDC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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