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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000969`

染色体: Chr07 坐标: 7013837-7016008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000969`
名称	SmilChr07G000969
描述	F-box protein At4g27050-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7013837 - 7016008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992138`
GeneID	`130992138`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992138`
原始查询	`LOC130992138`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At4g27050-like
产物	F-box protein At4g27050-like
Arabidopsis	`AT4G27050` (AT4G27050) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828813] identity=25.6; qcov=0.989; evalue=1.01e-17; confidence=low
Rice	`Os11g0533800` (OsFbox602) - identity=25.6; qcov=0.947; evalue=2.36e-22; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08387 (FBD); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992138

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772645.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772645.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772645.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772645.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7013920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B49,B60
`Chr7:7013937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B4,B49,B60,C86
`Chr7:7013974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C86,D11
`Chr7:7013992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B49,B60
`Chr7:7013993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr7:7014009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr7:7014070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr7:7014080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr7:7014109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr7:7014115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D6
`Chr7:7014117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:7014196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772645.1

450 aa

225

450

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

FBD

PF00646 F-box 5-40 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 92-402 aa PF08387 FBD 365-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772645.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	5	40	2.3e-06	28.0	F-box domain
`XP_057772645.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	92	402	3.8e-20	73.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057772645.1`	Pfam	`PF08387`	FBD	Repeat	365	400	7.1e-06	26.5	FBD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916662.1
TCTAGATTTATAGATTCTTAACCTACAGCTCATGTTTATCTAAGTTTTAGTATCATCTAAACTCCTTTTTGAAAAACCACGATTGCTATTTGCTAGTTAGCTATCTCGATCTAAATGAAAACTTAAAACCAAAACCATAATCTTTAGGTCGAAGGTTTTTTTTTGCCTATTAATCATCATTGCAGAAAATAGTTTATTGGAAGCAAACGTGGTTGATCGTCAGCGTCCGAAGTCTCTCTCTAGACAAGGTATGGGGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992138
ATGGGGAATTCAATCGACAGTCTACCAGATGATCTGCTAATTTCCATAGTGTCGTTTTTACCCGTCAAAGAAGCAGCAACAACTTGCACCGTTGCAAAAAGATGGCAAAATTTATGGATGTTTTCTAGGGTTTTGGAGTTTGATGGTTCAAAAATGGCACCAAAATTTGAGAATGGGAATAGAATATCGGTAGAGAGAGAGAAGGAAATTTTTGTTAATTGTGTGAATAGAGTGTTGGACTTACATTTGAGTGAAACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772645.1
MGNSIDSLPDDLLISIVSFLPVKEAATTCTVAKRWQNLWMFSRVLEFDGSKMAPKFENGNRISVEREKEIFVNCVNRVLDLHLSETIDEFNLALQLYSPNLNHNHYRSVIDRWILFALRKKVRKLKLDFNPNLNYLFRLGLDAYAFPNIAHDFSSALLDQSALVSLVSLSLTRVSTSGEIVGFFISNCPFLQVLHLKHVCGLGSLSPRSPAIRLRSLVIFDCKDIASIEICSPSLVSFEFTILNSSTYATLVLNGVSSLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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