当前解析结果
SmilChr07G000961| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000961 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000961 |
| 描述 | peroxisomal membrane protein 13 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 6932539 - 6935238 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992157 |
|---|---|
| GeneID | 130992157 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992157 |
| 原始查询 | LOC130992157 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | peroxisomal membrane protein 13 |
| 产物 | peroxisomal membrane protein 13 |
| Arabidopsis | AT3G07560 (PEX13)peroxin 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819945] identity=70.3; qcov=0.427; evalue=1.05e-54; confidence=low |
| Rice | Os07g0152800- identity=53; qcov=0.993; evalue=5.27e-71; confidence=high |
| GO | GO:0005777 (peroxisome); GO:0005778 (peroxisomal membrane); GO:0016560 (protein import into peroxisome matrix, docking); GO:1990429 (peroxisomal importomer complex) |
| KEGG | smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992157 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 1.00000 | XP_057772668.1 |
| 2 | Peroxisome membrane | 过氧化物酶体膜 | 0.80000 | XP_057772668.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772668.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772668.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772668.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:6933929 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr7:6934018 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr7:6934111 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B1,B71 |
Chr7:6935048 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B10,B137,B99,C1,C37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。