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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000943`

染色体: Chr07 坐标: 6728200-6730657 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000943`
名称	SmilChr07G000943
描述	bifunctional bis(5'-adenosyl)-triphosphatase/adenylylsulfatase FHIT
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6728200 - 6730657 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992172`
GeneID	`130992172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992172`
原始查询	`LOC130992172`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bifunctional bis(5'-adenosyl)-triphosphatase/adenylylsulfatase FHIT
产物	bifunctional bis(5'-adenosyl)-triphosphatase/adenylylsulfatase FHIT
Arabidopsis	`AT5G58240` (FHIT) FRAGILE HISTIDINE TRIAD [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835936] identity=79.9; qcov=0.981; evalue=3.31e-92; confidence=high
Rice	`Os11g0120600` - identity=75; qcov=0.968; evalue=9.52e-86; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01230 (HIT); PF11969 (DcpS_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057772696.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057772696.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057772697.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772696.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772696.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6728462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B18,B23,C53,C54
`Chr7:6728508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D6
`Chr7:6728562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:6730135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C12,C43,C46,C76
`Chr7:6730443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr7:6730496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772696.1

211 aa

106

211

DcpS_C

HIT

PF11969 DcpS_C 68-158 aa PF01230 HIT 69-160 aa

XP_057772697.1

157 aa

157

DcpS_C

HIT

PF11969 DcpS_C 14-104 aa PF01230 HIT 15-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772696.1`	Pfam	`PF11969`	DcpS_C	Family	68	158	1.8e-05	25.9	Scavenger mRNA decapping enzyme C-term binding
`XP_057772696.1`	Pfam	`PF01230`	HIT	Domain	69	160	1.8e-26	93.3	HIT domain
`XP_057772697.1`	Pfam	`PF11969`	DcpS_C	Family	14	104	7.8e-06	27.0	Scavenger mRNA decapping enzyme C-term binding
`XP_057772697.1`	Pfam	`PF01230`	HIT	Domain	15	106	8.7e-27	94.3	HIT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916713.1
TTCTCTCCTGATTATGGTCTATGAGAGAGGTGAGAAACTCACAATCAGTTACCGCGCGAGTACGCGACTTTATTGACACTTCTAAAAAACTACACGCGCCGCCGCTTTCTCTTTGGAGAACTGCGCGCTGATGTTAAAGGTTTCGCCTTTCCTTACTTCCCGTCGTATTCCAACCGCGTTTCTCTACCTACACCCCTCCACGCGCGGCCTCTTCCTCCGCCATTACTCGCCTCCGCTCCCGCCCTTTTCACCCTCAGCCG...

XM_057916714.1
GTCGTATTCCAACCGCGTTTCTCTACCTACACCCCTCCACGCGCGGCCTCTTCCTCCGCCATTACTCGCCTCCGCTCCCGCCCTTTTCACCCTCAGCCGGAAACTACTGCTTCACTCACAGCGCTCATAGGGCAAATGGAATCTGAGAGTTTTGCATTTGGTCCGTACAAAATCGACCCCAAAGAAGTATTCTACTCCACTCAATCCTCGTACGCTATGGTCAATTTGCGGCCTCTTCTTCCCGGTCACGTGCTTGTCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992172
ATGTTAAAGGTTTCGCCTTTCCTTACTTCCCGTCGTATTCCAACCGCGTTTCTCTACCTACACCCCTCCACGCGCGGCCTCTTCCTCCGCCATTACTCGCCTCCGCTCCCGCCCTTTTCACCCTCAGCCGGAAACTACTGCTTCACTCACAGCGCTCATAGGATGGAATCTGAGAGTTTTGCATTTGGTCCGTACAAAATCGACCCCAAAGAAGTATTCTACTCCACTCAATCCTCGTACGCTATGGTCAATTTGCGGCC...

LOC130992172
ATGGAATCTGAGAGTTTTGCATTTGGTCCGTACAAAATCGACCCCAAAGAAGTATTCTACTCCACTCAATCCTCGTACGCTATGGTCAATTTGCGGCCTCTTCTTCCCGGTCACGTGCTTGTCTGCCCAAGACGTGATGTTAAGCGCTTCATTGATCTCACTGCTGATGAGACTAGTGATCTATGGCTTACGGCACAGAAGATTGGGCGCCAGCTTGAGTCCTACCATAAGGCATCTTCACTGACGCTTACAATCCAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772696.1
MLKVSPFLTSRRIPTAFLYLHPSTRGLFLRHYSPPLPPFSPSAGNYCFTHSAHRMESESFAFGPYKIDPKEVFYSTQSSYAMVNLRPLLPGHVLVCPRRDVKRFIDLTADETSDLWLTAQKIGRQLESYHKASSLTLTIQDGPQAGQTVPHVHIHILPRKVGDFENNDEIYDAIDVKEKELKEKLDLDKERKDRSMEEMVEEAAQYRKLFI

XP_057772697.1
MESESFAFGPYKIDPKEVFYSTQSSYAMVNLRPLLPGHVLVCPRRDVKRFIDLTADETSDLWLTAQKIGRQLESYHKASSLTLTIQDGPQAGQTVPHVHIHILPRKVGDFENNDEIYDAIDVKEKELKEKLDLDKERKDRSMEEMVEEAAQYRKLFI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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