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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003346`

染色体: Chr01 坐标: 52228330-52230730 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003346`
名称	SmilChr01G003346
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52228330 - 52230730 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992205`
GeneID	`130992205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992205`
原始查询	`LOC130992205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=29; qcov=0.948; evalue=2.83e-72; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.8; qcov=1.01; evalue=5.01e-71; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057772740.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772740.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772740.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772740.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52228490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B57,B77,C86
`Chr1:52228614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:52228618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:52228693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:52228724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr1:52229203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C68
`Chr1:52229205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C68
`Chr1:52229229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C68
`Chr1:52229259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:52229364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B40,C18,C56,C62
`Chr1:52229534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B78
`Chr1:52229534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772740.1

670 aa

335

670

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 145-310 aa PF23559 WHD_DRP 399-469 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772740.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	145	310	1.3e-40	139.5	NB-ARC domain
`XP_057772740.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	399	469	1e-18	67.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916757.1
AGAGATAGAGAATTTACTAAGTCCAAATTCTCTCTCTTTTGCTACTTATTTTTTCTTAGAAAGTGCAGAGTATTTGTTTATGTTGCAAGTGTTGGATTCATTCATAAAGTATACTGTTTTCCTCTGTTTCTGTGTTTAGGAAGGGTAGATATGGCGTATGCTGCGCTTCTCTCGGCTTTGCAAGCGCTGAGGAAGGCAACGCAGCAAGATCACTTGTACAATTTGTCCACAATCAAACATCAAATCACAATTCTTGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992205
ATGGCGTATGCTGCGCTTCTCTCGGCTTTGCAAGCGCTGAGGAAGGCAACGCAGCAAGATCACTTGTACAATTTGTCCACAATCAAACATCAAATCACAATTCTTGATGAAAAGTTGTGTTTCTTGCAAGATTTCCTCGAAAATGATCCGCCGGCAGGCGGAATAGCTACTGATTCTCTGGAAGGACGCATCAGAGAAGCTGCGTATCAAGCTGAAGACATCGTAGACTTCCATGTCCAAAATCCGCTTGTCCCTGTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772740.1
MAYAALLSALQALRKATQQDHLYNLSTIKHQITILDEKLCFLQDFLENDPPAGGIATDSLEGRIREAAYQAEDIVDFHVQNPLVPVTVRRSIYQDFQNVVDEVVSIVQQVVVIKESRKEIKALQLSDHTYGDAPIGKTAMVGFDDELMEIKNQLCGGSTNVKVVSLVGMAGIGKTTLATNVFCDPCVEYHFHVRAWTAVTQDHRRSNILRGLLHSMAENSSPGSEQVDELVYKSLKGRRYLVVLDDMWSTEAWDDVKMIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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