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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001092`

染色体: Chr07 坐标: 8030907-8036273 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001092`
名称	SmilChr07G001092
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 6-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8030907 - 8036273 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992266`
GeneID	`130992266`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992266`
原始查询	`LOC130992266`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 6-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 6-like
Arabidopsis	`AT1G52520` (FRS6) FAR1-related sequence 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841683] identity=47.2; qcov=0.923; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0608300` - identity=35.8; qcov=0.933; evalue=3.09e-137; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992266

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772806.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772806.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772806.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772806.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8032062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C46,C84
`Chr7:8032133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr7:8032414`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,B106,B28,C45,C78
`Chr7:8032414`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A2,B106,B28,C45,C78
`Chr7:8032761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr7:8032842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:8033024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C14,C73
`Chr7:8033114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr7:8033140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:8033141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:8033142`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	118	A1,A16,A18,A22,A24,A25,A3,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B11,B112,B113,B114,B118,B119,B127,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B138,B18,B19,B22,B23,B24,B27,B30,B31,B32,B33,B34,B41,B42,B43,B48,B49,B5,B50,B54,B57,B60,B62,B64,B68,B71,B73,B74,B76,B79,B8,B84,B85,B88,B89,B9,B91,B93,B95,B97,B98,B99,C1,C11,C14,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C24,C27,C3,C31,C33,C34,C36,C41,C44,C46,C48,C50,C52,C53,C54,C57,C58,C6,C61,C64,C65,C66,C69,C73,C74,C8,C80,C82,C87,D1,D2,D3,D5,D6,D8
`Chr7:8033145`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	93	A16,A18,A24,A25,A3,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B106,B107,B112,B113,B114,B119,B129,B13,B130,B132,B135,B136,B138,B18,B19,B23,B24,B27,B30,B31,B32,B33,B34,B41,B42,B43,B48,B49,B50,B54,B62,B64,B68,B71,B73,B74,B76,B79,B8,B84,B85,B89,B9,B91,B93,B98,B99,C1,C11,C18,C19,C2,C20,C22,C27,C3,C31,C33,C34,C36,C41,C46,C48,C50,C53,C57,C58,C61,C64,C66,C69,C73,C74,C80,C82,C87,D1,D3,D5,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772806.1

673 aa

336

673

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 61-141 aa PF10551 MULE 265-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772806.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	61	141	1.4e-20	74.5	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057772806.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	265	358	7.6e-22	78.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091265.1
AAATATAGGGGCCTAATCGAAATACCACTAAAATGTAGGGGCCTAAATGTATAAATTTTTATGAAATTAATTGGACGGGAACAAAAGTTTGCAAGGGTACATCCGACAATTCGACCAAAATTGCGAAGATGTGATAATGTGAACCGGAGGCACTGCTTTGTCTGTACAACCAACCACATCTGAAGGACTGCTCCACCGCCGGACCGCCGCGATTTCCCGGCCGCGCCGCCGATTAAATATCGCCATTAGTCGAGAATGGA...

XM_057916823.1
AAATATAGGGGCCTAATCGAAATACCACTAAAATGTAGGGGCCTAAATGTATAAATTTTTATGAAATTAATTGGACGGGAACAAAAGTTTGCAAGGGTACATCCGACAATTCGACCAAAATTGCGAAGATGTGATAATGTGAACCGGAGGCACTGCTTTGTCTGTACAACCAACCACATCTGAAGGACTGCTCCACCGCCGGACCGCCGCGATTTCCCGGCCGCGCCGCCGATTAAATATCGCCATTAGTCGAGAATGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992266
ATGGATGACGTTTCTCTCAATAGCGAACCTACGTATGATGAGGAGGCTGAGGAATTTGAGATTGATGGAGAATGTGCAATGACAGAATATGTTGGCCAAACTGGCGACGTTTTACAAGGTGATAATCCTCTGCCTCCTGCTGTTGGGATGGAATTCGAGTCCTACGATGATGTTTATTTCTTTTACAATTGTTATGCAAAACAACAAGGATTCGGAGTAAGAGTAAGTAATACATGGTATAGAAAGAGCAAGGAGAGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772806.1
MDDVSLNSEPTYDEEAEEFEIDGECAMTEYVGQTGDVLQGDNPLPPAVGMEFESYDDVYFFYNCYAKQQGFGVRVSNTWYRKSKERYRGKLSCSSAGFKKKTDANRPRPETRTGCPAMIKFRLMDNKRWRIIETELEHNHLTSPTNDNIYKSHKIMDLGSKRPLPINGADEVQRIRLFRTVVIDAEDNGVSNFDEGDFRDNIDQGDNKLKLKLGDSQEMLKFFTRMQLNDPSFFYMMDINEKGCLRNVFWAEARCRAAYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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