当前解析结果
SmilChr07G001093| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001093 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001093 |
| 描述 | checkpoint protein hus1 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 8034953 - 8036060 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992267 |
|---|---|
| GeneID | 130992267 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992267 |
| 原始查询 | LOC130992267 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | checkpoint protein hus1 |
| 产物 | checkpoint protein hus1 |
| Arabidopsis | AT1G52530 (AT1G52530)Hus1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841684] identity=64.2; qcov=1.01; evalue=1.24e-150; confidence=high |
| Rice | Os04g0528400 (OsHUS1)- identity=55.8; qcov=1.04; evalue=2.45e-132; confidence=high |
| GO | GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006289 (nucleotide-excision repair); GO:0030896 (checkpoint clamp complex); GO:0031573 (mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling); GO:0033314 (mitotic DNA replication checkpoint signaling); GO:0035861 (site of double-strand break); GO:0044778 (meiotic DNA integrity checkpoint signaling) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04005 (Hus1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992267 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772807.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057772807.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057772807.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.20000 | XP_057772807.1 |
| 5 | PML body | PML body | 0.20000 | XP_057772807.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:8035125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr7:8036028 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C72 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772807.1PF04005
Hus1 1-293 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772807.1 |
Pfam | PF04005 |
Hus1 | Family | 1 | 293 | 5.9e-65 | 219.9 | Hus1-like protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。