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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001095`

染色体: Chr07 坐标: 8062475-8067833 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001095`
名称	SmilChr07G001095
描述	signal recognition particle subunit SRP54 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8062475 - 8067833 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992269`
GeneID	`130992269`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992269`
原始查询	`LOC130992269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal recognition particle subunit SRP54 2
产物	signal recognition particle subunit SRP54 2
Arabidopsis	`AT1G48900` (AT1G48900) Signal recognition particle, SRP54 subunit protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841312] identity=88.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0772800` (srp54-1) - identity=91.3; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005786 (signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting); GO:0005829 (cytosol); GO:0006614 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane); GO:0006616 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, translocation); GO:0008312 (7S RNA binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0030942 (endoplasmic reticulum signal sequence receptor activity)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00448 (SRP54); PF02492 (cobW); PF02881 (SRP54_N); PF02978 (SRP_SPB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992269

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772815.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057772815.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057772815.1`
4	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057772815.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772815.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8062860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:8063984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:8064149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B48,C11,C69,C87
`Chr7:8065104`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B77
`Chr7:8065104`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B77
`Chr7:8066188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr7:8066189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:8066489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772815.1

495 aa

248

495

SRP54_N

SRP54

cobW

SRP_SPB

PF02881 SRP54_N 6-83 aa PF00448 SRP54 102-296 aa PF02492 cobW 103-252 aa PF02978 SRP_SPB 310-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772815.1`	Pfam	`PF02881`	SRP54_N	Domain	6	83	3.3e-14	53.6	SRP54-type protein, helical bundle domain
`XP_057772815.1`	Pfam	`PF00448`	SRP54	Domain	102	296	2.2e-78	263.1	SRP54-type protein, GTPase domain
`XP_057772815.1`	Pfam	`PF02492`	cobW	Domain	103	252	4.8e-06	27.0	CobW/HypB/UreG, nucleotide-binding domain
`XP_057772815.1`	Pfam	`PF02978`	SRP_SPB	Domain	310	443	6e-38	130.8	Signal peptide binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916832.1
TAAAAATCTGTTTGTAATTACTTAAATGTGAATGTGAATTGTGAGCGTATTAATTATTTAGATGGAAAAGGGGTAGAAACTTTAGAAAAATATTTAGGCAGTGAGTCGCAAGAATTCTTCTGAAAGATCGTAATTACAAAATCCAAATCCATTCATTCTCACTTGCCTTGCCTTGGTTTGTAGATATCGCCCTAATCCACAACACCCTGATTCTCTCCCTCTCTCTTTCCCGGCGACCCAGGCTAAACCCTAAACCTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992269
ATGGTGCTCGCACAGTTAGGAGGGAGCATCTCCCGTGCTCTTCAACAGATGAGCAATGCGACTATCATTGACGAGAAAGTGCTCAACGATTGTCTAAACGAGATCACGCGTGCGCTTCTCCAATCCGATGTTCAGTTCAAGCTCGTTCGCGATATGCAGACCAATATCAAGAAGATCGTCAATCTCGATGATCTAGCAGCTGGCCACAATAAACGTAAAATCATCCAACAGGCTGTTTTTAATGAGCTATGTAAAATACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772815.1
MVLAQLGGSISRALQQMSNATIIDEKVLNDCLNEITRALLQSDVQFKLVRDMQTNIKKIVNLDDLAAGHNKRKIIQQAVFNELCKILDPGKPSFTPKKGKTSVVMFVGLQGSGKTTTCTKYAYYHQKKGYKPALVCADTFRAGAFDQLKQNATKAKIPFYGSYTESDPVRIAVEGVERFKKENCDLIIVDTSGRHKQEAALFEEMRQVSEATKPDLVIFVMDSSIGQAAFDQAQAFKESVPVGAVIITKMDGHAKGGGAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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