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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001104`

染色体: Chr07 坐标: 8142333-8147019 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001104`
名称	SmilChr07G001104
描述	uncharacterized SmilChr07G001104
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8142333 - 8147019 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992279`
GeneID	`130992279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992279`
原始查询	`LOC130992279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832808]; symbol=AT5G27490; hit=AT5G27490; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832808]; symbol=AT5G27490; hit=AT5G27490; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G27490` (AT5G27490) Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832808] identity=76.2; qcov=1; evalue=1.13e-164; confidence=high
Rice	`Os01g0610500` - identity=64.6; qcov=1.05; evalue=6.32e-131; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0031267 (small GTPase binding)
KEGG	-
Pfam	PF04893 (Yip1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057772827.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057772827.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057772827.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057772827.1`
5	Cis-golgi network	Cis-golgi network	0.40000	`XP_057772827.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8145315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B58
`Chr7:8146751`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B112
`Chr7:8146751`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B112

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772827.1

280 aa

140

280

Yip1

PF04893 Yip1 111-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772827.1`	Pfam	`PF04893`	Yip1	Domain	111	269	3.2e-16	60.4	Yip1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916844.1
AAAAAGACTTTTAGATGACGAAATAGGAAAATCTACTGTTACTAAAAATTTGGTTAGTCTCTACTACAGTGGGGCCCCCAAGAAAAATATAATTAAATGTTTCCATGAATCCTAATGTGTTTTATCAACCTCTCTTCCCCAATCTCAGATTATCAGCTAAAAACACATCAAACTTATGCATACACATTAGATACAGAGTGTAATTCGGCTATAAACGAATCGAATTGTCAAGATGATGTCCGGCAATTACACTTCGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992279
ATGATGTCCGGCAATTACACTTCGATCGACAATCAAAATGTTGCCGGATCTGTTCCGGCAGTCGCCGATCCGCCGGCGCATGTTGCCGTTAAATTCGCTGATTCCAGTCTTCAGACATTTCCGCCTTCGGGAGCTCAGGGGAAAATATCTGGTGCCGCGCAACCTCCTCGTGATGCCGATGATTCGTTTGGCAAGCCTGTGGCCGGTTCTGATGAACCTCAGCAAAGTGGTTGGTTTCGGTCATTCACAATTGCTGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772827.1
MMSGNYTSIDNQNVAGSVPAVADPPAHVAVKFADSSLQTFPPSGAQGKISGAAQPPRDADDSFGKPVAGSDEPQQSGWFRSFTIAAYRPYFDVDTADVLERIKDSLFPFKGSFSEKTANNPDLYGPFWICTTLIFVAASIGTFVTYIAHKVQKKEWDYDINLMTWSAGLFYGYVSIVPLALYLILKYFSVPSGFVHLLCLYGYSLFVFIPAMCLSVIPQEIVRWVVAGVAGFMSATFVALNLRNHIKSAGESWFVIVAGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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