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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001108`

染色体: Chr07 坐标: 8179331-8181374 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001108`
名称	SmilChr07G001108
描述	protein POST-ILLUMINATION CHLOROPHYLL FLUORESCENCE INCREASE, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8179331 - 8181374 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992284`
GeneID	`130992284`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992284`
原始查询	`LOC130992284`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein POST-ILLUMINATION CHLOROPHYLL FLUORESCENCE INCREASE, chloroplastic
产物	protein POST-ILLUMINATION CHLOROPHYLL FLUORESCENCE INCREASE%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G15840` (PIFI) post-illumination chlorophyll fluorescence increase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820827] identity=64.4; qcov=1; evalue=2.49e-126; confidence=high
Rice	`Os03g0586500` (OSJNBa0010D22.23) - identity=69; qcov=0.747; evalue=9.38e-110; confidence=high
GO	GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0009579 (thylakoid); GO:0010478 (chlororespiration)
KEGG	-
Pfam	PF25419 (Ig_PIFI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992284

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772831.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057772831.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057772831.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772831.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772831.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8179958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:8180445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:8180624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:8180657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr7:8181240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:8181299`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A19,A9,B105,B121,B128,B129,B136,B15,B21,B26,B32,B44,B45,B64,B69,B73,B8,C34,C35,C5,C51,C56,C6,C79,D10,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772831.1

281 aa

140

281

Ig_PIFI

PF25419 Ig_PIFI 81-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772831.1`	Pfam	`PF25419`	Ig_PIFI	Domain	81	210	4.2e-72	241.3	PIFI-like, immunoglobulin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916848.1
TTTAAATTCTCAGATTATGCTATCCTTGTTCATCTGAACCCAACTCTTCTATCTACTATCTTTAGCTTGCAAGAATGGCTGCAGCAGCAGCAACTACTACAAGTGCATCTCTTTTTAATTCTTCTAAGCAAATTGCATCTACTAGTGGTGGAGTTGCTTCAAGATCACATGCTGTTCGATTCTTCGGTGCTCCTGTGCGGACCAGTGCTCCAATCAAGAGAAAATCGAACAAGATCAGTGGGAAAGTCACTGCTGCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992284
ATGGCTGCAGCAGCAGCAACTACTACAAGTGCATCTCTTTTTAATTCTTCTAAGCAAATTGCATCTACTAGTGGTGGAGTTGCTTCAAGATCACATGCTGTTCGATTCTTCGGTGCTCCTGTGCGGACCAGTGCTCCAATCAAGAGAAAATCGAACAAGATCAGTGGGAAAGTCACTGCTGCAGCTTCAGTTGCAGCAGCTCCTGCTGAGGAACTTAAAGAATATGTGCTTCCTTCGTGGGCTGAATTCGACCTTGGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772831.1
MAAAAATTTSASLFNSSKQIASTSGGVASRSHAVRFFGAPVRTSAPIKRKSNKISGKVTAAASVAAAPAEELKEYVLPSWAEFDLGRAPVYWKTMNGLPPTAGERLKLFYNPAARNLVPNEEYGVAFNGGFNQPIMCGGEPRAMLKRVRGKADPPYYTIQICIPKHALSLIFSFTNGSEWDGPYRLQFQVPKAWRNKPTEFFTEGLAEELSREGACEEAIFPDTNVVVTSCAMIGNLSVEGGDRCSLDLVLGCTDPTSPM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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