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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001130`

染色体: Chr07 坐标: 8469785-8472864 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001130`
名称	SmilChr07G001130
描述	DNAJ protein JJJ1 homolog
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8469785 - 8472864 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992303`
GeneID	`130992303`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992303`
原始查询	`LOC130992303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNAJ protein JJJ1 homolog
产物	DNAJ protein JJJ1 homolog
Arabidopsis	`AT1G74250` (AT1G74250) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843765] identity=46.7; qcov=1.08; evalue=4.91e-164; confidence=high
Rice	`Os12g0502700` (OsDjC81) - identity=44.3; qcov=1.04; evalue=9.98e-130; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF12171 (zf-C2H2_jaz); PF12874 (zf-met); PF21884 (ZUO1-like_ZHD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992303

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772855.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772855.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057772855.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772855.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8471109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:8471208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:8471466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B69
`Chr7:8471646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B19
`Chr7:8471664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A24,B25,C16,C20
`Chr7:8471712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B51
`Chr7:8471712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:8471728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:8471914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr7:8472039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:8472434`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	103	A1,A10,A13,A14,A16,A2,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B10,B100,B103,B109,B114,B115,B119,B121,B122,B124,B126,B127,B13,B132,B14,B140,B16,B19,B2,B24,B25,B29,B30,B32,B36,B37,B44,B46,B48,B49,B51,B54,B55,B59,B6,B62,B63,B69,B73,B74,B75,B77,B81,B86,B88,B89,B9,B91,B97,C1,C11,C13,C15,C17,C18,C19,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C31,C32,C34,C37,C38,C4,C40,C44,C45,C46,C47,C49,C52,C59,C63,C68,C69,C70,C71,C72,C74,C79,C80,D1,D3,D4
`Chr7:8472439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A24,B25,C16,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772855.1

605 aa

302

605

DnaJ

ZUO1-like_ZHD

zf-met

zf-C2H2_jaz

PF00226 DnaJ 9-74 aa PF21884 ZUO1-like_ZHD 126-232 aa PF12874 zf-met 295-319 aa PF12171 zf-C2H2_jaz 295-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772855.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	9	74	9.1e-21	74.4	DnaJ domain
`XP_057772855.1`	Pfam	`PF21884`	ZUO1-like_ZHD	Domain	126	232	5.7e-20	72.6	Zuotin-like, zuotin homology domain
`XP_057772855.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	295	319	5.3e-07	30.5	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057772855.1`	Pfam	`PF12171`	zf-C2H2_jaz	Family	295	320	4.5e-10	40.1	Zinc-finger double-stranded RNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916872.1
TTGTACTCCATTTGGCACGTGGTGAGCTGAAATCTCCGGCACACCGACTCCAACCCTAACGTATTTATACGCAAATGCAAAGACGGCGAGAGAAAAAGAAACCCCGCACCACACCGTCGCCAAATGGCGTCGTCGGAGAAGCGGTGCTTATACGAAGTCCTCGGCCTCAGCCGCGACTGCTCCACCGACGAAATCCGCTCCGCCTACAGGCGCCTCGCCCTCCAGCGTCACCCGGACAAGCTCGTTAGGAGCGGCCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992303
ATGGCGTCGTCGGAGAAGCGGTGCTTATACGAAGTCCTCGGCCTCAGCCGCGACTGCTCCACCGACGAAATCCGCTCCGCCTACAGGCGCCTCGCCCTCCAGCGTCACCCGGACAAGCTCGTTAGGAGCGGCCTCCCCGAGGCTGACGCCACCGCGGCCTTCCAGGAGCTCGTCAACGCCTACGAGGTTCTCTCCGACGAGCGCGAGCGCGCCTGGTACGATTCCCACCGCAATCAGATCCTCTTCTCCTCCTCTTCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772855.1
MASSEKRCLYEVLGLSRDCSTDEIRSAYRRLALQRHPDKLVRSGLPEADATAAFQELVNAYEVLSDERERAWYDSHRNQILFSSSSSSTAAGGSSAFVPDLFSFFSNSVYSGYSDSGRGFYKVYRDLFEKIYANELNFAKKLGMPLPREAPVMGNLESPYVQVTAFYSYWLGFTTVLEFFWADQYDAMAGPNRKSRRLMEEENKKLRKKARREYNETVRGLAEFVKKRDKRVIDMQIKRNEEMERKREEEKQRKKELERQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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