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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001136`

染色体: Chr07 坐标: 8526903-8530483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001136`
名称	SmilChr07G001136
描述	uncharacterized SmilChr07G001136
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8526903 - 8530483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992310`
GeneID	`130992310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992310`
原始查询	`LOC130992310`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841692]; symbol=AT1G52600; hit=AT1G52600; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841692]; symbol=AT1G52600; hit=AT1G52600; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G52600` (AT1G52600) Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841692] identity=79.4; qcov=1; evalue=7.4e-102; confidence=high
Rice	`Os05g0297900` (OsSigP4) - identity=74.4; qcov=1; evalue=1.42e-94; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0005787 (signal peptidase complex); GO:0006465 (GO:0006465); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00717 (Peptidase_S24); PF31032 (SPase_CTS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057772865.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057772865.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057772866.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772865.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772865.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8527042`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C30
`Chr7:8527042`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C30
`Chr7:8527850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,D10
`Chr7:8530153`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C23,D10
`Chr7:8530153`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C23,D10
`Chr7:8530177`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A11,B38,B39,B5,C17,C2,C37,C60,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772865.1

228 aa

114

228

Peptidase_S24

PF00717 Peptidase_S24 37-143 aa

XP_057772866.1

180 aa

180

Peptidase_S24

SPase_CTS

PF00717 Peptidase_S24 37-144 aa PF31032 SPase_CTS 152-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772865.1`	Pfam	`PF00717`	Peptidase_S24	Domain	37	143	5.1e-09	36.6	Peptidase S24-like
`XP_057772866.1`	Pfam	`PF00717`	Peptidase_S24	Domain	37	144	2.9e-09	37.4	Peptidase S24-like
`XP_057772866.1`	Pfam	`PF31032`	SPase_CTS	Domain	152	177	1.5e-08	34.7	Signal peptidase C-terminal short helix

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916883.1
ATGCAACCAATCAGAATTCGCCTCTGCTGTCACACTTTAAACACAGTTAATTCTCCGCAAATGCAGAAAAATTAGCAATTTCAGTTGTAGAATCAAGTGAAGAAAAAATGGGGTGGATTGAAGACGCCGTGACTTCTGTCAAATCTATCCAACTGCGGCAGGCCCTCCATCAGACAATCAGCATCGGTTTAATTGTCACATCCGCGTTGATGATATGGAAGGCGTTGATGTGTATAACTGGAAGTGAATCCCCCGTTGTT...

XM_057916882.1
GTCACACTTTAAACACAGTTAATTCTCCGCAAATGCAGAAAAATTAGCAATTTCAGTTGTAGAATCAAGTGAAGAAAAAATGGGGTGGATTGAAGACGCCGTGACTTCTGTCAAATCTATCCAACTGCGGCAGGCCCTCCATCAGACAATCAGCATCGGTTTAATTGTCACATCCGCGTTGATGATATGGAAGGCGTTGATGTGTATAACTGGAAGTGAATCCCCCGTTGTTGTTGTTCTTTCCGAAAGTATGGAACCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992310
ATGGGGTGGATTGAAGACGCCGTGACTTCTGTCAAATCTATCCAACTGCGGCAGGCCCTCCATCAGACAATCAGCATCGGTTTAATTGTCACATCCGCGTTGATGATATGGAAGGCGTTGATGTGTATAACTGGAAGTGAATCCCCCGTTGTTGTTGTTCTTTCCGAAAGTATGGAACCTGGATTTGCTAGGGGAGACATTCTGTTCTTACGTATGAGCAAAGAACCAATTCGAGCAGGCGAGATTGTTGTGTATAATAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772865.1
MGWIEDAVTSVKSIQLRQALHQTISIGLIVTSALMIWKALMCITGSESPVVVVLSESMEPGFARGDILFLRMSKEPIRAGEIVVYNINGRDIPIVHRVIKVHERSDTGEVAVLTKGDNNDEDDISLYAPGQRWLQRKHIIGRAVGFLPHVGWATIIMTEKPLIKVDSSSYVFCYLPISLAVLENDVNLVFSPCSCSTFLLGDSACSSLHPRTNKTKLDRRIHQLLSSN

XP_057772866.1
MGWIEDAVTSVKSIQLRQALHQTISIGLIVTSALMIWKALMCITGSESPVVVVLSESMEPGFARGDILFLRMSKEPIRAGEIVVYNINGRDIPIVHRVIKVHERSDTGEVAVLTKGDNNDEDDISLYAPGQRWLQRKHIIGRAVGFLPHVGWATIIMTEKPLIKYILIGGLGLLVITSKD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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