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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001141`

染色体: Chr07 坐标: 8566167-8568946 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001141`
名称	SmilChr07G001141
描述	peptide deformylase 1A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8566167 - 8568946 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992316`
GeneID	`130992316`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992316`
原始查询	`LOC130992316`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide deformylase 1A, chloroplastic
产物	peptide deformylase 1A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G15390` (PDF1A) peptide deformylase 1A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838109] identity=73.7; qcov=0.782; evalue=1.99e-108; confidence=high
Rice	`Os01g0555800` (OsPDF1A) - identity=73; qcov=0.721; evalue=1.14e-101; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009507 (chloroplast); GO:0018206 (peptidyl-methionine modification); GO:0031365 (N-terminal protein amino acid modification); GO:0042586 (peptide deformylase activity); GO:0043686 (GO:0043686)
KEGG	-
Pfam	PF01327 (Pep_deformylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992316

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772871.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057772871.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057772871.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772871.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8566435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr7:8566517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B72,B90,B92,C21,C25
`Chr7:8566618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C82
`Chr7:8568255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:8568572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:8568605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B55,C33,C46
`Chr7:8568713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B63,B70,B83,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772871.1

262 aa

131

262

Pep_deformylase

PF01327 Pep_deformylase 75-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772871.1`	Pfam	`PF01327`	Pep_deformylase	Domain	75	240	9.6e-49	165.7	Polypeptide deformylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916888.1
AGTACACGAACGAAAGCAAATCGAAAGTACAAAAACACAAGACTGCTTATAGTAAAAGCCCACCAAAAATGGGGTCAATTTCAATTTCAATTTCAATTTCAATTTCAGTTTCGAAGCCCAATCTTTTAATTTTCAGCAATAAAAAGCATTTCCTTAAATAAATAAAAGTGCAAATCAAAAGAGCTACAAATTTGGCAATGGCAACCATTCAAAGATTCAGTCACCGCATCCTTCTTCCCTTAACTTACTTCAACTTCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992316
ATGGCAACCATTCAAAGATTCAGTCACCGCATCCTTCTTCCCTTAACTTACTTCAACTTCAGACCCATTTCGCGAACGCCCATTCTGACCCGACCCGTGAGCGGGCCCGGAAGACCCGCATTCGGACCCGTGGCCGTAGCGCCGAGAAGAAACCGCAGCTCCGGTTCGGCAGCCCGGGCCGGGTGGTTCCTGGGCAAGCGCGAGAAGAAGGATGAGCTGCCGGAGATAGTGAAAGCCGGCGACCCGGTTCTCCACGAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772871.1
MATIQRFSHRILLPLTYFNFRPISRTPILTRPVSGPGRPAFGPVAVAPRRNRSSGSAARAGWFLGKREKKDELPEIVKAGDPVLHEPAQEVRPEEIGSERIQKIIDDMVKVMRGAPGVGLAAPQIGIPLKIIVLEDTIEYMRYTTKEEIKAQNRRPFDLLVVINPKLKKKGDKSAFFFEGCLSVNGFRAIVERHSEVEVTGFDRSGQAIKVDASGWQARIFQHECDHLDGTLYVDKMVPRTFRTVENLDLPLPAGCPKLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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