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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001144`

染色体: Chr07 坐标: 8591721-8594094 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001144`
名称	SmilChr07G001144
描述	uncharacterized SmilChr07G001144
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8591721 - 8594094 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992318`
GeneID	`130992318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992318`
原始查询	`LOC130992318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PSF1; symbol=PSF1; hit=Os05g0453900; species=rice; confidence=high
产物	PSF1; symbol=PSF1; hit=Os05g0453900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G80190` (PSF1) partner of SLD five 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844359] identity=59.7; qcov=0.823; evalue=5.28e-61; confidence=high
Rice	`Os05g0453900` (PSF1) - identity=52.9; qcov=0.939; evalue=4.43e-62; confidence=high
GO	GO:0000811 (GINS complex); GO:0006260 (DNA replication); GO:1902983 (DNA strand elongation involved in mitotic DNA replication)
KEGG	-
Pfam	PF05916 (Sld5); PF24997 (PSF1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772874.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057772875.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772874.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772874.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8593200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B91,C19,C31,C60
`Chr7:8593641`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr7:8593641`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr7:8593788`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B14
`Chr7:8593788`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772874.1

227 aa

114

227

Sld5

PSF1_C

PF05916 Sld5 70-161 aa PF24997 PSF1_C 173-221 aa

XP_057772875.1

224 aa

112

224

Sld5

PSF1_C

PF05916 Sld5 70-161 aa PF24997 PSF1_C 173-223 aa

XP_057772876.1

181 aa

181

Sld5

PSF1_C

PF05916 Sld5 24-115 aa PF24997 PSF1_C 127-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772874.1`	Pfam	`PF05916`	Sld5	Domain	70	161	1.6e-11	45.0	GINS complex protein helical bundle domain
`XP_057772874.1`	Pfam	`PF24997`	PSF1_C	Domain	173	221	2.1e-25	88.8	PSF1 C-terminal domain
`XP_057772875.1`	Pfam	`PF05916`	Sld5	Domain	70	161	1.6e-11	45.0	GINS complex protein helical bundle domain
`XP_057772875.1`	Pfam	`PF24997`	PSF1_C	Domain	173	223	1.3e-27	95.8	PSF1 C-terminal domain
`XP_057772876.1`	Pfam	`PF05916`	Sld5	Domain	24	115	9.5e-12	45.8	GINS complex protein helical bundle domain
`XP_057772876.1`	Pfam	`PF24997`	PSF1_C	Domain	127	175	1.7e-25	89.0	PSF1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916891.1
GGCTTAAAGTTTTTACATCTCCCGCCAAAAGTATGCTCTGCCCCCCCTTTTTTTCTTGAGAGAATGCTCAGCTCACAGCCTCACACTACGCCTTTTCCGTCTCAATTTCTCCACCGTCGAGTTCATCTGATCTCTTCGTTTCTTGAAGACCTATTATCATAATCTCCGCCTTCCCTAATTTCAAAGCCCGGAAAACGTTTGGCTGCAAAAAGTTGTACCCGTTTGAAATTTGAGGAAAAATGTACGGGAGAAAAGCAAGT...

XM_057916892.1
GGCTTAAAGTTTTTACATCTCCCGCCAAAAGTATGCTCTGCCCCCCCTTTTTTTCTTGAGAGAATGCTCAGCTCACAGCCTCACACTACGCCTTTTCCGTCTCAATTTCTCCACCGTCGAGTTCATCTGATCTCTTCGTTTCTTGAAGACCTATTATCATAATCTCCGCCTTCCCTAATTTCAAAGCCCGGAAAACGTTTGGCTGCAAAAAGTTGTACCCGTTTGAAATTTGAGGAAAAATGTACGGGAGAAAAGCAAGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992318
ATGTACGGGAGAAAAGCAAGTGAATTAGTGAAGGAATTCGCTAGTTGTGAGCCTGGGCAGATTTGTACTTTCAATAATGACCTTTTTGCTCAAGTGCTTGAAGAATGTGATGGGCATCTCCTTCACCTTCAGCCTTTAATGAGGAAAATACAAGAGCATGAAAATAAATTGAAAGATAAAAGGAGATCAGAAGAGGAAATTGGAATTTCAGAAGATGAAACGAGGAACTCTGAAGCTGAGAAGACACTCATCCAAAATGC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057772874.1
MYGRKASELVKEFASCEPGQICTFNNDLFAQVLEECDGHLLHLQPLMRKIQEHENKLKDKRRSEEEIGISEDETRNSEAEKTLIQNALKSDQFGALVHHLSLVRNKRCLMAYVYKRAEVIRSLGWMVDSVLPEEIQEKLNTTEKEYFKNHAATLQSYMAELDLHLTVDMIPPKDPYIKVRVLDDIGEIALSDQVANLARHAIMFLRRTDAEQYITQVALQLICLLCH

XP_057772875.1
MYGRKASELVKEFASCEPGQICTFNNDLFAQVLEECDGHLLHLQPLMRKIQEHENKLKDKRRSEEEIGISEDETRNSEAEKTLIQNALKSDQFGALVHHLSLVRNKRCLMAYVYKRAEVIRSLGWMVDSVLPEEIQEKLNTTEKEYFKNHAATLQSYMAELDLHLTVDMIPPKDPYIKVRVLDDIGEIALSDQVANLARHAIMFLRRTDAEQYITQGQMEELTG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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