当前解析结果
SmilChr07G001152| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001152 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001152 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001152 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 8641180 - 8643671 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992326 |
|---|---|
| GeneID | 130992326 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992326 |
| 原始查询 | LOC130992326 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | aspartate-glutamate racemase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838111]; symbol=AT1G15410; hit=AT1G15410; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | aspartate-glutamate racemase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838111]; symbol=AT1G15410; hit=AT1G15410; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G15410 (AT1G15410)aspartate-glutamate racemase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838111] identity=54.9; qcov=0.752; evalue=5.31e-98; confidence=high |
| Rice | Os01g0555200- identity=42.6; qcov=0.894; evalue=1.28e-75; confidence=medium |
| GO | GO:0006807 (GO:0006807); GO:0036361 (GO:0036361) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01177 (Asp_Glu_race) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992326 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057772897.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772897.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772897.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772897.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057772897.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:8641919 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B110 |
Chr7:8642209 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B131,B56,B96,C31 |
Chr7:8642302 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:8642775 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772897.1PF01177
Asp_Glu_race 65-300 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772897.1 |
Pfam | PF01177 |
Asp_Glu_race | Family | 65 | 300 | 1.6e-20 | 74.5 | Asp/Glu/Hydantoin racemase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。