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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003425`

染色体: Chr01 坐标: 52917001-52923875 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003425`
名称	SmilChr01G003425
描述	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52917001 - 52923875 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992331`
GeneID	`130992331`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992331`
原始查询	`LOC130992331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
产物	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
Arabidopsis	`AT1G53050` (AT1G53050) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841739] identity=58.4; qcov=0.674; evalue=5.92e-154; confidence=high
Rice	`Os01g0367700` (Orysa) - identity=64.7; qcov=0.573; evalue=2.97e-156; confidence=medium
GO	GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0008353 (RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity); GO:0032968 (positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992331

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772911.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057772911.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057772911.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057772911.1`
5	Dendrite	Dendrite	0.20000	`XP_057772911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52917164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:52917354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C46
`Chr1:52917357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C46
`Chr1:52918302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,D1
`Chr1:52918738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:52918759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B82,B90
`Chr1:52918873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:52923363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772911.1

564 aa

282

564

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 118-400 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 121-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772911.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	118	400	1e-66	225.8	Protein kinase domain
`XP_057772911.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	121	335	9.6e-34	117.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916928.1
GGGTTTTGTAGGTTGGCAAAAAGCCTAATGAAAGAGTCATATCTTACAAACCATGCTTCGTAATCAACGGAAGAAGCTAAGTTAATTAGTTTACCTTTTCCAAAATATCTATTATAAATTATTTTACAAAACGCATAATATACATAGATATTCCAAATTCCCTCTGCCGGCCTCAATTCTACATCATCTTACCTCATTTATATACTGCAAAATCTTGTCTTACTCTCTCATCTACAAATGTCCCATTTCCCTTATTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992331
ATGGGGTCCTCACAAAGTTCAAAAACATACGTGAAATCTCCGCCGATGGAGATGGAGAAGCTAAGGCTGGTTAATGGTAGCATGAAGGAGGGCCCGGTGAGGCCGACGAGGAACCCGAGCTCCCGGGGGAGAGGCGGGGCCCACCCGGGGCACGAGGCGAGGAGGAGTGCTAGCAATAGCGGCAGCGGTGATGGAGATAGGGGTGGCGAAGTTTCTAGAAGGAGTGGTGATGGCTTGATGAATAAGGGTGGTGGTGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772911.1
MGSSQSSKTYVKSPPMEMEKLRLVNGSMKEGPVRPTRNPSSRGRGGAHPGHEARRSASNSGSGDGDRGGEVSRRSGDGLMNKGGGEDDELVGGWPKWLVDNIPSHVLKNIVPKSADSYTKIDKVGQGTYSNVYKARDKDSGKLVALKKVRFDTSEPESVKFMAREIMILQKLDHPNILKLEGLATSRMQYSLYLVFDYMYSDLSRMLSRPDERLTEPQIKCYMQQLFSGLQHCHERGVLHRDIKGSNLLIDRNGMLKIGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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