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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001193`

染色体: Chr07 坐标: 9061792-9063432 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001193`
名称	SmilChr07G001193
描述	probable NOT transcription complex subunit VIP2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9061792 - 9063432 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992370`
GeneID	`130992370`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992370`
原始查询	`LOC130992370`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable NOT transcription complex subunit VIP2
产物	probable NOT transcription complex subunit VIP2
Arabidopsis	`AT5G59710` (VIP2) VIRE2 interacting protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836092] identity=66.2; qcov=0.718; evalue=1.74e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0736000` - identity=58.2; qcov=0.709; evalue=2.4e-41; confidence=medium
GO	GO:0000289 (nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening); GO:0000932 (P-body); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030015 (CCR4-NOT core complex)
KEGG	-
Pfam	PF03643 (Vps26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992370

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772952.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057772952.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772952.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772952.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9062019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr7:9062029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C19
`Chr7:9062056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B6,B82,C67,C9
`Chr7:9062328`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A16,A22,A5,A9,B100,B103,B119,B133,B139,B16,B31,B58,B6,B63,B82,B83,B86,B87,B90,B92,C20,C25,C27,C48,C58,C59,C74,C81,C9,D11
`Chr7:9062331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B51,C35,D10
`Chr7:9062834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B14,B89,C44,C6
`Chr7:9062835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B109
`Chr7:9062835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr7:9062921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B140
`Chr7:9063015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B109,B82
`Chr7:9063015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B82
`Chr7:9063296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772952.1

206 aa

103

206

Vps26

PF03643 Vps26 148-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772952.1`	Pfam	`PF03643`	Vps26	Family	148	199	3.5e-17	63.0	Vacuolar protein sorting-associated protein 26

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916969.1
ATGCAGGGACTGCATAATCTTCATGGAAACTTTAATGTTCCAAACATGCCAGGTGCACTTGGATCGAGAAGTACAACTATGAATAACATTGCTTCAAGTGGGTTGCAACAAGCTTCTGGCAACCTTTCTACCGGACGTTTTGCATCCAACAACCTTCCAGTTGCTCTTTCTCAGATATCTCACAGCAATACACATGTTCATTCAGGGATGGCAAGTAGGGGTGGTATGAATGTCATAGGAAACCAAGGGTATAGTAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992370
ATGCAGGGACTGCATAATCTTCATGGAAACTTTAATGTTCCAAACATGCCAGGTGCACTTGGATCGAGAAGTACAACTATGAATAACATTGCTTCAAGTGGGTTGCAACAAGCTTCTGGCAACCTTTCTACCGGACGTTTTGCATCCAACAACCTTCCAGTTGCTCTTTCTCAGATATCTCACAGCAATACACATGTTCATTCAGGGATGGCAAGTAGGGGTGGTATGAATGTCATAGGAAACCAAGGGTATAGTAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772952.1
MQGLHNLHGNFNVPNMPGALGSRSTTMNNIASSGLQQASGNLSTGRFASNNLPVALSQISHSNTHVHSGMASRGGMNVIGNQGYSSSTNGVGGTIPGILPTSAAIGNRTSVPGLGVSPVLGNAGQRITSSMGSMVGGGNIGRNISSGGSITHFQDFVVWNYTPPPSINNSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKGKYAMLTLNSVLPVHLR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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