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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001202`

染色体: Chr07 坐标: 9163015-9168029 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001202`
名称	SmilChr07G001202
描述	katanin p60 ATPase-containing subunit A1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9163015 - 9168029 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992378`
GeneID	`130992378`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992378`
原始查询	`LOC130992378`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	katanin p60 ATPase-containing subunit A1
产物	katanin p60 ATPase-containing subunit A1
Arabidopsis	`AT1G80350` (ERH3) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844375] identity=84.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0683100` (OsKTN60) - identity=79.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0008568 (microtubule severing ATPase activity); GO:0015630 (microtubule cytoskeleton); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0051013 (microtubule severing)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF09336 (Vps4_C); PF17862 (AAA_lid_3); PF21126 (KATNA1_MIT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992378

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057772960.1`
2	Phragmoplast	Phragmoplast	0.60000	`XP_057772960.1`
3	Spindle	Spindle	0.60000	`XP_057772960.1`
4	Spindle pole	Spindle pole	0.60000	`XP_057772960.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057772960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9163272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:9165777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C51
`Chr7:9165888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr7:9167064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772960.1

520 aa

260

520

KATNA1_MIT

AAA

AAA_lid_3

Vps4_C

PF21126 KATNA1_MIT 11-71 aa PF00004 AAA 272-409 aa PF17862 AAA_lid_3 431-473 aa PF09336 Vps4_C 473-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772960.1`	Pfam	`PF21126`	KATNA1_MIT	Domain	11	71	2.5e-18	66.3	Katanin p60 subunit A1, MIT domain
`XP_057772960.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	272	409	3.1e-39	135.1	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057772960.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	431	473	2e-13	50.3	AAA+ lid domain
`XP_057772960.1`	Pfam	`PF09336`	Vps4_C	Domain	473	518	7.7e-12	45.7	Vps4 C terminal oligomerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916977.1
GATCTCCTTTCATTTTATTTTGATTGGAATTAATTTTTCCTTTTTTTTAGTAATGTATAGTTGAGGGATAAGAAATGAAAATTTAAAAATGTCGTAATAAAATTATTTAAAATCCAAGGGTCGAAGTGTAATTATCCCCTTCTCCCTTTCTTCTCAGTCGACCGTTTAAACGTCGCCGTCGTCCCCATTTCTATGGCGTCAACCCCACCAAATTTTGAATCCTTCACCATATATATGTATCCGTTGCGTTTCATTTCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992378
ATGGTGGGTGCTTCTCTGGCGGGATTGCAAGATCATGTGAAATTAGCGAGAGAGTACGCAGTGGAAGGACTCTATGACACTGCCGTTATCTTCTTCGATGGCGCCATTGCTCAGATCAACAAGCATTTGAATATGGTTGATGACCCCTTGCTTCGTACGAAATGGATGAATGTAAAAAAAGCCATATCAGAAGAAACAGAGGTAGTGAAACAGTTAGATGCTGAGAAAAGGTCATTCAAGGAGGTTCATGTTGGTAGACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772960.1
MVGASLAGLQDHVKLAREYAVEGLYDTAVIFFDGAIAQINKHLNMVDDPLLRTKWMNVKKAISEETEVVKQLDAEKRSFKEVHVGRRPNSPPISTKSSFVFQPLDEYPTSSGGPMDDPDVWRPPSRDPTGRRPARSGQVGMRKSPQDGTWARGGSAKAASRGGRTGASSKVNTGVRASSTTGKKGSAKSTSGKSDSVNGDAEEGKPKKVQYEGPDADLAAMLERDVLDSSPGVRWDDVAGLSEAKRLLEEAVVLPLWMPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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