当前解析结果
SmilChr07G001218| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001218 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001218 |
| 描述 | purine permease 3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 9319402 - 9321734 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992395 |
|---|---|
| GeneID | 130992395 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992395 |
| 原始查询 | LOC130992395 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | purine permease 3-like |
| 产物 | purine permease 3-like |
| Arabidopsis | AT1G28220 (PUP3)purine permease 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839716] identity=56.7; qcov=0.936; evalue=2.99e-137; confidence=high |
| Rice | Os09g0467400 (OsPUP3)- identity=59.6; qcov=0.904; evalue=3.29e-134; confidence=high |
| GO | GO:0015211 (purine nucleoside transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00892 (EamA); PF16913 (PUNUT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992395 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Vacuole | 液泡 | 1.00000 | XP_057772991.1 |
| 2 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.80000 | XP_057772991.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057772991.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772991.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772991.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:9319749 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr7:9319750 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr7:9319763 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B59,C14 |
Chr7:9319956 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B22,C20,C35,C70 |
Chr7:9319959 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,B66 |
Chr7:9320135 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C43 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772991.1PF16913
PUNUT 13-326 aa
PF00892
EamA 73-155 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772991.1 |
Pfam | PF16913 |
PUNUT | Family | 13 | 326 | 2e-110 | 369.7 | Purine nucleobase transmembrane transport |
XP_057772991.1 |
Pfam | PF00892 |
EamA | Domain | 73 | 155 | 3.3e-07 | 31.4 | EamA-like transporter family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。