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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001220`

染色体: Chr07 坐标: 9346282-9349423 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001220`
名称	SmilChr07G001220
描述	uncharacterized SmilChr07G001220
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9346282 - 9349423 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992397`
GeneID	`130992397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992397`
原始查询	`LOC130992397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844330]; symbol=AT1G79910; hit=AT1G79910; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844330]; symbol=AT1G79910; hit=AT1G79910; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G79910` (AT1G79910) Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844330] identity=35.9; qcov=0.904; evalue=8.22e-72; confidence=medium
Rice	`Os02g0159200` - identity=44.4; qcov=0.479; evalue=6.85e-56; confidence=medium
GO	GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03398 (Ist1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057772994.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772994.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772994.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772994.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772994.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9346840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B1,B101,B69,C30
`Chr7:9347683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C2,D10
`Chr7:9347987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:9347990`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B38,B39
`Chr7:9347990`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:9348101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C71
`Chr7:9348113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C71
`Chr7:9348483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:9348588`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A3,A4,B125,B139,B61,B63,B70,B80,B81,B83,B87,C50,C56,C63,C76,D4,D5,D7
`Chr7:9348598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:9348632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:9348690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772994.1

428 aa

214

428

Ist1

PF03398 Ist1 15-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772994.1`	Pfam	`PF03398`	Ist1	Family	15	168	1.5e-47	162.3	Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917011.1
AATTTAAAGCAAGCACGACAGCCTGTTCACAACTTTCTCTCTCTAAACTACATATATATACCCTTTTTTGAGCGCATTATTTGCACCAAAAATACACCATTACCGAATCTTGATCTTCTTCGGGCTGTCGATTGGGTGTCCTAAATGCATTTCGGTTGCATGAAAAACCCTTTTTCCAGTTTTCCTTTTCTTTCATAATCGAAATTCTTGCTCTTGCCTTCAAACCTCATTATTCCCTTGAGTTTCCCTACCTCAAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992397
ATGTTTGACGCCCTGTTGAAAAGCAAGTTTTTTTCCAAATGCAAGTCGGATATTAAGCTGACGCGGACACGAATCGAGATTATAACGAAAAAGAGAAATGCAACACAGAAATATCTGAGGAATGATGTTGCTGATCTGCTTAGAAATGGACTGGATACTGACGCCTTTGCCAGGGCTGAAGGGCTTCTTGCTGAGATGATCAGGTCTCAATGTTACGAGCTAATCGACGAGTACTGTGAACATATCTTGAAGAATCTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772994.1
MFDALLKSKFFSKCKSDIKLTRTRIEIITKKRNATQKYLRNDVADLLRNGLDTDAFARAEGLLAEMIRSQCYELIDEYCEHILKNLSAMNKQRECPEECREAAASLMFAAARFADLPELRELRTVFSERYGKSLDYYVNKQFTEKLKANPPSKDMKLQLLQEIAAESGLEWDAKALENKLFNESAFAKSRVDGSAQKDAAGYEFGRTNPERKKESPADARKEAVRKVFEEEGDEDEPLKLRRTPPYTKPVPNKATSSSSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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