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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001223`

染色体: Chr07 坐标: 9361708-9363904 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001223`
名称	SmilChr07G001223
描述	uncharacterized SmilChr07G001223
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9361708 - 9363904 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992401`
GeneID	`130992401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992401`
原始查询	`LOC130992401`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826957]; symbol=AT4G13270; hit=AT4G13270; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826957]; symbol=AT4G13270; hit=AT4G13270; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G13270` (AT4G13270) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826957] identity=44.8; qcov=0.969; evalue=3.41e-61; confidence=medium
Rice	`Os03g0696000` - identity=43.9; qcov=0.686; evalue=2.25e-48; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057772999.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057772999.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772999.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772999.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9361984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:9362019`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B132
`Chr7:9362019`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B132
`Chr7:9362118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B136,B3,C15
`Chr7:9362146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:9362154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772999.1

231 aa

116

231

LEA_2

PF03168 LEA_2 103-198 aa

XP_057773000.1

230 aa

115

230

LEA_2

PF03168 LEA_2 103-198 aa

XP_057773001.1

226 aa

113

226

LEA_2

PF03168 LEA_2 103-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772999.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	103	198	2.8e-09	38.1	Late embryogenesis abundant protein
`XP_057773000.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	103	198	2.8e-09	38.1	Late embryogenesis abundant protein
`XP_057773001.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	103	198	2.7e-09	38.1	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917018.1
AGTGGAGCGGCGACAATGATTGGTGACAGTTAAAAATGCGACAACGAATACGCGCATTCACGTACCGACTTGACGAAACCGCACAGACCGAACTGAACAGAAGACCGCTGTGGTGGACCCCACCCATCTCCTCCTCCTTTTTTACTCTGTGAATGATATAATCATATATACATGTGTATGTAATACTCCCTTTGTGTGTGTATAGGACACACAATCATGACAGCCAAGAAACAGTCTGATGCGGCGTCGTTTCAGCAGCC...

XM_057917017.1
ATAATCATATATACATGTGTATGTAATACTCCCTTTGTGTGTGTATAGGACACACAATCATGACAGCCAAGAAACAGTCTGATGCGGCGTCGTTTCAGCAGCCTCTCCTCGTCGACCCCCTATCCCCGCAGCCACAACCCACGCCGTACGTTCTACCCCAATATCCTCCACCTAACCGCCCCCGCCTCCTCCGCAGGGCTTGGCGGCGATGCATATTCTGCCTCGCCATCTTCCTCCTCTTCCTCGTCGCCGCCGTATAC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992401
ATGACAGCCAAGAAACAGTCTGATGCGGCGTCGTTTCAGCAGCCTCTCCTCGTCGACCCCCTATCCCCGCAGCCACAACCCACGCCGTACGTTCTACCCCAATATCCTCCACCTAACCGCCCCCGCCTCCTCCGCAGGGCTTGGCGGCGATGCATATTCTGCCTCGCCATCTTCCTCCTCTTCCTCGTCGCCGCCGTATACCTCCTCTGGCCATCCAATCCCGAGCTCTCCGTCGTCCGCTTCCGCCTCGACCGCCTCCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057772999.1
MTAKKQSDAASFQQPLLVDPLSPQPQPTPYVLPQYPPPNRPRLLRRAWRRCIFCLAIFLLFLVAAVYLLWPSNPELSVVRFRLDRLQFHTTPTISLDATLDLTIKIENPDMYSLDYDSLLVAIGYRGKQLGYVTSDRGSVMARESSYVNATLQLDGVEILTDVILLIEDLAKGAVVFDTTSVISGRLGFFFFDLPLETKIQCEVLVDTQNQTVTRQSCYPEPMLLPVSNSQ

XP_057773000.1
MTAKKQSDAASFQQPLLVDPLSPQPQPTPYVLPQYPPPNRPRLLRRAWRRCIFCLAIFLLFLVAAVYLLWPSNPELSVVRFRLDRLQFHTTPTISLDATLDLTIKIENPDMYSLDYDSLLVAIGYRGKQLGYVTSDRGSVMARESSYVNATLQLDGVEILTDVILLIEDLAKGAVVFDTTSVISGRLGFFFFDLPLETKIQCEVLVDTQNQTVTRQSCYPEVEWLEPDNV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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