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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G001235

染色体: Chr07 坐标: 9453819-9457885 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G001235
名称SmilChr07G001235
描述uncharacterized SmilChr07G001235
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向9453819 - 9457885 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130992412
GeneID130992412
locus_tag-
NCBI NameLOC130992412
原始查询LOC130992412

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述structural molecules protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717438]; symbol=AT1G79985; hit=AT1G79985; species=arabidopsis; confidence=high
产物structural molecules protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717438]; symbol=AT1G79985; hit=AT1G79985; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT1G79985 (AT1G79985)
structural molecules protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717438]
identity=66; qcov=0.987; evalue=1.2e-74; confidence=high
RiceOs01g0593600
-
identity=66.9; qcov=0.993; evalue=7.58e-68; confidence=high
GOGO:0000139 (Golgi membrane); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0006895 (Golgi to endosome transport); GO:0034067 (protein localization to Golgi apparatus); GO:0043001 (Golgi to plasma membrane protein transport)
KEGG-
PfamPF09801 (SYS1)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130992412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Endoplasmic reticulum 内质网 0.80000 XP_057773020.1
2 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 0.80000 XP_057773020.1
3 Golgi apparatus 高尔基体 0.60000 XP_057773020.1
4 Vesicle 囊泡 0.20000 XP_057773020.1
5 Endosome 内体 0.20000 XP_057773020.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773020.1
152 aa
N
1
76
152
SYS1
C
PF09801 SYS1 5-144 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057773020.1 Pfam PF09801 SYS1 Family 5 144 4.3e-45 154.2 Integral membrane protein S linking to the trans Golgi network

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057917037.1
TAATAAATGAACCAAGAGGAAATATAAAAAACGCATAATATAATACTTCTCCTTATATAAATTCAACTGCTCTCAAACTTCTAAGTTCTTTGATTATTATTCCTTTAATCTGATCTAACTCCACCCAAATCTGCAACCCCGTTTACAGTTTACGCCACATACAATCACTTTTCAATTGTTTCTAAATCCTACAAAAATCCTTCTCCACTGAGTGAATCCCCAAATTTTAGGTTATTCTGTTCAAACCCAGGCGAATTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130992412
ATGTTCTATGGTTCGGTGGTATGGGATCCATGGCTGATAGTGGCGCAAATCGTGTGCCTCCAGTGCCTGTACTACCTGGCGCTGGGGGTATTCTTGTCAATTCTGGTGGGCACTCGGGTTTCGAAGATGAGCCTTGTGTATTTCTTTGATTATGCCACGGTTGATGCCTCCACCGTTATTGGTTGGGGTGTGATGTCTTCCATTTTTTTCAGCTCTATTGCGGGAGCTGGTTTTCTAGTCTATTTAGTTGAAAGGGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057773020.1
MFYGSVVWDPWLIVAQIVCLQCLYYLALGVFLSILVGTRVSKMSLVYFFDYATVDASTVIGWGVMSSIFFSSIAGAGFLVYLVERAKKCLDFCATLYIVHLFICTIYGGWPASITWWVVNLTGLTAMALLGEYLCMRRELREIPISRFRSSA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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