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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001237`

染色体: Chr07 坐标: 9479840-9489034 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001237`
名称	SmilChr07G001237
描述	coatomer subunit beta'-2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9479840 - 9489034 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992414`
GeneID	`130992414`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992414`
原始查询	`LOC130992414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coatomer subunit beta'-2
产物	coatomer subunit beta'-2
Arabidopsis	`AT1G52360` (AT1G52360) Coatomer, beta' subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841666] identity=84.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0143900` (OsWD40-125) - identity=82.9; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030126 (COPI vesicle coat)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF04053 (B-prop_COPA_B_2nd); PF23953 (TPR_COPA_B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992414

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057773022.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057773022.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057773022.1`
4	Endosome	内体	0.60000	`XP_057773022.1`
5	Midbody	Midbody	0.60000	`XP_057773022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9482168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:9482216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:9482264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:9482795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B78,B82,C32,C68
`Chr7:9486206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:9487530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:9487895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B77
`Chr7:9488741`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773022.1

919 aa

460

919

WD40

B-prop_COPA_B_2nd

TPR_COPA_B

PF00400 WD40 15-43 aa PF00400 WD40 91-127 aa PF00400 WD40 133-171 aa PF00400 WD40 177-215 aa PF00400 WD40 220-256 aa PF04053 B-prop_COPA_B_2nd 319-578 aa PF23953 TPR_COPA_B 595-775 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773022.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	15	43	2.5e-53	176.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773022.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	91	127	2.5e-53	176.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773022.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	133	171	2.5e-53	176.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773022.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	177	215	2.5e-53	176.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773022.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	220	256	2.5e-53	176.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057773022.1`	Pfam	`PF04053`	B-prop_COPA_B_2nd	Repeat	319	578	5.3e-90	302.0	COPA/B second beta-propeller
`XP_057773022.1`	Pfam	`PF23953`	TPR_COPA_B	Repeat	595	775	2.7e-82	275.5	COPA/B TPR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917039.1
GCAAATAAAATAAAGTGAAATAGAAAAAGAAAAGAACGAGAAATTCACCTTCATCTCTTCGATAGAAATTTTAACACTCTTTTGCTCTGTTGTTGTAGGAGTGGAAAACCCCCATTCTCTCTCTACATTTTGCATACCAATACGCGCACTTTATATCTCTTGATCGCAGCATTCGAGTACATATTGCTCGGTGGATCTTTGCCGTAAGATCGATAGGGTTTCCCAGCTGCGGAACTTAGTATAGAAAATGCCGCTCAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992414
ATGCCGCTCAGACTAGAAATCAAGAGGAAGCTTGCGCAAAGATCAGAAAGAGTAAAATCTGTGGATCTACATCCAACAGAGCCATGGATATTGGCGAGCCTGTATTCGGGGACTGTTTGCATCTGGAATTATCAGACCCAGACAATGGTTAAATCTTTTGAGGTTACTGAACTACCAGTTAGATCTGCTAAGTTTATAGCACGAAAGCAGTGGGTGGTTGCTGGTGCTGATGATATGTTCATTCGTGTCTACAATTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773022.1
MPLRLEIKRKLAQRSERVKSVDLHPTEPWILASLYSGTVCIWNYQTQTMVKSFEVTELPVRSAKFIARKQWVVAGADDMFIRVYNYNTMDKVKVFEAHTDYIRCVAVHPTLPYVLSSSDDMLIKLWDWEKGWACTQIFEGHSHYVMQVTFNPKDTNTFASASLDRTIKIWNLGSPDPNFTLDAHLKGVNCVDYFTGGDKPYLITGSDDHTAKVWDYQTKSCVQTLEGHTHNVSAVCFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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