当前解析结果
SmilChr07G001246| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001246 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001246 |
| 描述 | protein TAP1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 9550392 - 9551038 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992422 |
|---|---|
| GeneID | 130992422 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992422 |
| 原始查询 | LOC130992422 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein TAP1-like |
| 产物 | protein TAP1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992422 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057773027.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057773027.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773027.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773027.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773027.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:9550473 |
CGT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B35 |
Chr7:9550473 |
CGT |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr7:9550508 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 110 | A1,A10,A14,A18,A20,A23,A25,A6,A8,B101,B106,B11,B110,B112,B114,B115,B118,B120,B124,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B137,B140,B16,B17,B18,B19,B25,B26,B28,B31,B32,B34,B36,B37,B46,B48,B49,B51,B58,B59,B61,B64,B65,B72,B73,B74,B76,B78,B79,B80,B81,B82,B84,B86,B89,B9,B94,B95,B98,C12,C13,C16,C2,C25,C26,C29,C3,C31,C32,C34,C35,C37,C39,C40,C41,C43,C45,C48,C50,C53,C54,C56,C57,C58,C60,C62,C63,C66,C68,C72,C75,C79,C80,C81,C85,C87,C9,D1,D2,D3,D7,D8 |
Chr7:9550587 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 17 | A18,A20,B101,B112,B124,B137,B16,B19,B26,B32,B36,B61,B76,C25,C53,C9,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。