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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001264`

染色体: Chr07 坐标: 9709619-9711581 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001264`
名称	SmilChr07G001264
描述	putative Peroxidase 48
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9709619 - 9711581 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992435`
GeneID	`130992435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992435`
原始查询	`LOC130992435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative Peroxidase 48
产物	putative Peroxidase 48
Arabidopsis	`AT4G33870` (AT4G33870) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829530] identity=46.9; qcov=0.898; evalue=2.02e-102; confidence=high
Rice	`Os01g0712800` (prx18) - identity=46.8; qcov=0.871; evalue=1.05e-91; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057773044.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773044.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773044.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773044.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9709850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:9709910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:9709992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:9710140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:9710211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:9710488`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A15,A25,A7,B10,B107,B119,B130,B134,B28,B4,B5,B70,C13,C18,C27,C32,C35,C37,C42,C47,C60,C62,C64,C68,C7,C77,D1
`Chr7:9710491`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A15,A25,A7,B10,B107,B130,B134,B28,B4,B5,B70,C13,C18,C27,C32,C35,C37,C42,C47,C60,C62,C64,C68,C7,C77,D1
`Chr7:9710529`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C72
`Chr7:9710529`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C72
`Chr7:9710531`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C72
`Chr7:9710531`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773044.1

373 aa

186

373

peroxidase

PF00141 peroxidase 70-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773044.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	70	339	1.3e-70	238.6	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917061.1
ATGGTTCATGACCTCACCAGTTATCTTCCTCATAGAATGTGCGTACACTGCACATAACAAAATTTTGTTAGTCAGATTCCAAATTACCTATCCACCCATACCATACAATACCCATAACTTCCAGCTGTAAGGGCAATCTCGTCATTTCCCCGTCGCTCCCTCAGTCCCTCTGGCGTACTATAAAACTACCTCCTATCAACTTCTGCAGCTCAAAACACACAATCTAACACGCACAACACTCACATTGAGAGAGAAGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992435
ATGGATCTCACAAAGAAACTAAGCATTCTGGTTTTTCTCTTGTGCGTTCTGACCTCTTTGAAGAATCAGAAGGCTGCAAGCGATTCACGTTCGGTTCTCCACGATCCATCGGCTCGGCGTGAAGAGGAGCTTCATTCTGATGCTCGAGTCAAGGAGCGTCTTAGATATGACTACTACAGCGAATCATGTCCGTCAGCTGAAAAGATAATCCGATCAACGGTCAGAGAATTGCACGAGATGAAGAATACTGTTGGTCCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773044.1
MDLTKKLSILVFLLCVLTSLKNQKAASDSRSVLHDPSARREEELHSDARVKERLRYDYYSESCPSAEKIIRSTVRELHEMKNTVGPALLRLAFHDCFVMGCDASILLDSDGNVKSEKEARPNRSIKGFEQIDTIKSRLEEACPGVVSCADTVALAARESVLLAGGQFYPVLTGRKDSIDAFQLNATTELPRPDDDFTKALRSFALKGFDARESVSLLGAHSTGKVHCNFIRKRLFNFTANKEPDSSINPEFLEILRAECG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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