Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001277`

染色体: Chr07 坐标: 9814983-9817746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001277`
名称	SmilChr07G001277
描述	uncharacterized SmilChr07G001277
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9814983 - 9817746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992448`
GeneID	`130992448`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992448`
原始查询	`LOC130992448`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0163300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0163300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G45688` (AT1G45688) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841102] identity=41.9; qcov=1.1; evalue=4.82e-74; confidence=medium
Rice	`Os06g0163300` - identity=57.2; qcov=1.02; evalue=2.92e-124; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992448

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773066.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057773066.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057773066.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773066.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773066.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9815266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:9815303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B34
`Chr7:9815321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B10,B130,C18,D1
`Chr7:9815395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B16,B95,C29,C54
`Chr7:9815456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B77,C62
`Chr7:9815718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917084.1
GCTCGGAGGCAGGTCCGGCTTCAGCCTCGGACTCAGTTGTGACTCCCTCTTCCCCTACAAAGCTAGTTGCCTTCATCACCACACAACCCACTCACTACTTCCCTCTTCACTTTCACCCTGCTTGCTGCCATGCACACACACTACACGCACTGACCCCTTTTTTTTGCTTTTTGGAACCTCTGCTTTCAATGCCTCACGCCAAATTCTCTCACTTGTTCCGTTTCTTCACATGGGATTATCAGATTATGTGCTTTTCTTGA...

XM_057917083.1
GCTCGGAGGCAGGTCCGGCTTCAGCCTCGGACTCAGTTGTGACTCCCTCTTCCCCTACAAAGCTAGTTGCCTTCATCACCACACAACCCACTCACTACTTCCCTCTTCACTTTCACCCTGCTTGCTGCCATGCACACACACTACACGCACTGACCCCTTTTTTTTGCTTTTTGGAACCTCTGCTTTCAATGCCTCACGCCAAATTCTCTCACTTGTTCCGTTTCTTCACATGGGATTATCAGATTATGTGCTTTTCTTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992448
ATGCAGCACGCAAAATCAGAATCGGATATAACAAGCTTAGCGCCATCGTCGCCGTCTCGATCTCCGAAGAGGGCGGTGTACTACGTGCAGAGCCCGTCTCGGGACTCCCACGATGGCGACAAGTCGTCGTCCATGCATGCAACCCCCAATTTCAACAGCCCCATGGAGTCCCCCTCGCACCCCTCCTTCGGCCGCCACTCCCGCAACTCCTCCGCCAGCCGATTCTCCGGCATCTTCCGGTCGTCGTCGGGGCGGAAGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773066.1
MQHAKSESDITSLAPSSPSRSPKRAVYYVQSPSRDSHDGDKSSSMHATPNFNSPMESPSHPSFGRHSRNSSASRFSGIFRSSSGRKGGRTKRNDKGWPECNVIVEEGNYDEFDDDKAYTRRCQLMLALLAFAVLFTVFCLIIWGAGRPFKAQVAIKSLTVNNMYMGSGADFTGVPTKMLNMNGSLRISVYNPATFYGIHVTATPVNLVYLDVVVATGELEKYYQHRKSHKNVVVHIEGTRVPLYGAASNLEVADGGAVQV...

XP_057773067.1
MQHAKSESDITSLAPSSPSRSPKRAVYYVQSPSRDSHDGDKSSSMHATPNFNSPMESPSHPSFGRHSRNSSASRFSGIFRSSSGRKGGRTKRNDKGWPECNVIVEEGNYDEFDDDKAYTRRCQLMLALLAFAVLFTVFCLIIWGAGRPFKAQVAIKSLTVNNMYMGSGADFTGVPTKMLNMNGSLRISVYNPATFYGIHVTATPVNLVYLDVVVATGELEKYYQHRKSHKNVVVHIEGTRVPLYGAASNLEVADGGAVQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器