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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001292`

染色体: Chr07 坐标: 9932383-9938467 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001292`
名称	SmilChr07G001292
描述	tRNAse Z TRZ4, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9932383 - 9938467 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992457`
GeneID	`130992457`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992457`
原始查询	`LOC130992457`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNAse Z TRZ4, mitochondrial-like
产物	tRNAse Z TRZ4%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G16260` (TRZ4) tRNAse Z4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820872] identity=65.5; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0232300` (TRZ3) - identity=69.9; qcov=0.263; evalue=5.24e-95; confidence=weak
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0042781 (3'-tRNA processing endoribonuclease activity); GO:1990180 (mitochondrial tRNA 3'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF13691 (Lactamase_B_4); PF23023 (Anti-Pycsar_Apyc1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992457

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057773077.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773077.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057773077.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773077.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9935586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:9935902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C35,C77
`Chr7:9935948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C35,C77
`Chr7:9935989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr7:9936031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B12,C3,C51,D1
`Chr7:9936661`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr7:9936661`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr7:9937083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B38,B39
`Chr7:9937496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B12,C3,C51,D1
`Chr7:9937651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C52
`Chr7:9937673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:9937680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773077.1

796 aa

398

796

Lactamase_B_4

Anti-Pycsar_Apyc1

PF13691 Lactamase_B_4 2-56 aa PF23023 Anti-Pycsar_Apyc1 438-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773077.1`	Pfam	`PF13691`	Lactamase_B_4	Domain	2	56	2.2e-18	66.4	tRNase Z endonuclease
`XP_057773077.1`	Pfam	`PF23023`	Anti-Pycsar_Apyc1	Family	438	518	2.2e-14	54.5	Anti-Pycsar protein Apyc1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917094.1
GAAAACAATGCAAATTAGAATTGGAGAAACGGTTTCGAGTTTTGAAGGCCTTTTATTTTTTGCCCCTTAAACCCTTCAAAAAATTAATCCAAAAACAATAAATAAGAAGATGTCTCAAACTTCAAACCTCCGCCTCCTCCTCTCTTCCGCCAACCACCGCTGCCGCCAACCTCTCTCCGCCGCCTCCTCTTTTCTCCCACAAAATCTCTCCTCTTCCGGTTCTTTCCCGTTTTCATTCAAAACCCACCTCAGAAATCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992457
ATGGATACACAAGACACATCCCCAGCAGTTTTACTGTTTTTTGACAAGCAAAGATTTATATTTAATGCTGGAGAAGGACTTCAACGTTTCTGCACCGAGCACAAGATCAAATTGTCGAAGATTGATCACATATTTCTCTCACGTGTCTGCTCAGAAACTGCTGGTGGACTTCCAGGTCTCTTATTAACTCTGGCGGGCATGGGGGACGAAGGGATGTCTGTGAATATGTGGGGTCCCTCAGATTTAAAATATTTACTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773077.1
MDTQDTSPAVLLFFDKQRFIFNAGEGLQRFCTEHKIKLSKIDHIFLSRVCSETAGGLPGLLLTLAGMGDEGMSVNMWGPSDLKYLLDAMKSFIPNAAMVHTRSFGPSPGSPSRVLQSFDNPFVLIDDEVVKISALLLRPNHEEVSSSPESVTNATKPGDLSVIYICELPEIKGKFDPRKAAALGLRPGPKFRELQLGNSVKSDSQDIMVHPSDVLGPSVPGPIVLLVDCPTSWHFRDLLTLQCLAPYYVDTANEVLEGSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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