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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001295`

染色体: Chr07 坐标: 9941828-9943165 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001295`
名称	SmilChr07G001295
描述	aquaporin TIP2-1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9941828 - 9943165 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992459`
GeneID	`130992459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992459`
原始查询	`LOC130992459`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin TIP2-1
产物	aquaporin TIP2-1
Arabidopsis	`AT3G16240` (DELTA-TIP) delta tonoplast integral protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820870] identity=81.6; qcov=1.01; evalue=1.59e-142; confidence=high
Rice	`Os06g0336200` (OsTIP2) - identity=80.5; qcov=0.992; evalue=1.24e-133; confidence=high
GO	GO:0006833 (water transport); GO:0015250 (water channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057773079.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057773079.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773079.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773079.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773079.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9942013`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr7:9942260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:9942632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:9942641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:9942703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:9942715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B69
`Chr7:9942970`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	120	A10,A13,A14,A16,A18,A19,A20,A22,A23,A24,A3,A4,A6,A8,B100,B102,B103,B104,B106,B113,B115,B118,B123,B125,B126,B127,B133,B139,B16,B18,B19,B20,B23,B24,B25,B26,B32,B33,B34,B35,B38,B39,B41,B42,B43,B46,B5,B50,B51,B54,B57,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B7,B70,B73,B75,B79,B80,B81,B83,B85,B86,B89,B9,B94,B97,B99,C1,C10,C13,C16,C17,C19,C22,C23,C26,C27,C28,C29,C32,C38,C41,C42,C43,C47,C5,C50,C53,C54,C56,C57,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C67,C68,C7,C74,C76,C79,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773079.1

248 aa

124

248

MIP

PF00230 MIP 15-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773079.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	15	232	2e-78	263.9	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917096.1
GACAACTACTCATCATGAAACTGAATTAAAAAATAATTATATATATCACAAATGCACCCAAAAAATCAAACTATATGTGGGATTCTTAGTATATAAATGTGACATAGAAAGTGCCTTAATTTGTACCTCAAAAACAATTCTTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTTCTTCTTATTCTTCACAAGACAAAAAAAATGCCGGGAATCGCTTTCGGCCGATTCGATGACTCGTTCAGCTTCGCCTCAATCAAGGCGTACATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992459
ATGCCGGGAATCGCTTTCGGCCGATTCGATGACTCGTTCAGCTTCGCCTCAATCAAGGCGTACATCGCTGAGTTCATCTCCACCATGCTCTTCGTCTTCGCCGGCGTCGGCTCCGCCATCGCTTACAATAAGTTGACGTCGGATGCCGCCCTCGACCCGGCGGGGCTGGTGGCGGTGGCAATCGCCCACGGATTCGCTCTCTTCGTAGCAGTTTCCATCGGCGCCAACATCTCCGGCGGCCACGTCAACCCCGCCGTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773079.1
MPGIAFGRFDDSFSFASIKAYIAEFISTMLFVFAGVGSAIAYNKLTSDAALDPAGLVAVAIAHGFALFVAVSIGANISGGHVNPAVTFGLAVGGQITILTGIFYWIAQLLGAIVASFLLSVVTGGLAIPTHGLAAGVGAVQGVVMEIIITFALVYTVYATAADPKKGSLGTIAPIAIGFIVGANILAAGPFSGGSMNPARSFGPAVASGDYAGNWVYWVGPLIGGGLAGAVYSNVFMHHEHAPLSTDF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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