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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001305`

染色体: Chr07 坐标: 10026172-10028865 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001305`
名称	SmilChr07G001305
描述	protein PLANT CADMIUM RESISTANCE 8-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10026172 - 10028865 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992470`
GeneID	`130992470`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992470`
原始查询	`LOC130992470`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PLANT CADMIUM RESISTANCE 8-like
产物	protein PLANT CADMIUM RESISTANCE 8-like
Arabidopsis	`AT1G52200` (AT1G52200) PLAC8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841650] identity=70.7; qcov=0.715; evalue=2.32e-68; confidence=high
Rice	`Os03g0830200` (OsFWL6) - identity=48.2; qcov=0.651; evalue=3.02e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04749 (PLAC8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992470

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773095.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773095.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773095.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773095.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10026508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C48,C82
`Chr7:10026508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C82
`Chr7:10026599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:10026622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B30
`Chr7:10026622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:10026675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B13,B21,C26,C5
`Chr7:10026677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:10026720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:10027403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:10027411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C73
`Chr7:10027427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr7:10028660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773095.1

172 aa

172

PLAC8

PF04749 PLAC8 41-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773095.1`	Pfam	`PF04749`	PLAC8	Family	41	139	5.2e-28	98.6	PLAC8 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917112.1
TACAAGTTTCGTAGTTGACTTTGAAATTCTTAGTATTTTTTAAAATCTTGATATGTTGAAGATAATGTCTATATATGAAGTAAAGAGAGAGCAGCTGCATGTACGAAGAAAGTAGCTGTCAATTACCATTATTGATCGGAGCTTAATCATGGGAAGAGTGGAGGTGGCCGCCGGCGACGTGGAGAGCCCCGCGAAGGGCGTAGCAGTGGCCTCATATCCCCAAAACCATCAGCCGATGCAGATGCAGCCTCAGTTCGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992470
ATGGGAAGAGTGGAGGTGGCCGCCGGCGACGTGGAGAGCCCCGCGAAGGGCGTAGCAGTGGCCTCATATCCCCAAAACCATCAGCCGATGCAGATGCAGCCTCAGTTCGTCGGAAGGCCATGGACCACTGGCCTATTTGACTGCCATCTTGACCAAACTAATGCTGTGATGACGGCGTTTTTACCTTGTGTGACGTTCGGACAGACAGCAGAGGTTTTGGATGCAGGGGAAATGAGTTGTCCACTGGGAAGTTTCGTATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773095.1
MGRVEVAAGDVESPAKGVAVASYPQNHQPMQMQPQFVGRPWTTGLFDCHLDQTNAVMTAFLPCVTFGQTAEVLDAGEMSCPLGSFVYMLMMPAVCSQWIMGSKYRTKLRNRYGLVEAPYSDVVSHLLCSCCALCQEFRELKARGLDPALGWNGIVAEQQYGTQPPPVQAMSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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