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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001306`

染色体: Chr07 坐标: 10029664-10032822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001306`
名称	SmilChr07G001306
描述	cytochrome c-type biogenesis CcmH-like mitochondrial protein
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10029664 - 10032822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992471`
GeneID	`130992471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992471`
原始查询	`LOC130992471`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c-type biogenesis CcmH-like mitochondrial protein
产物	cytochrome c-type biogenesis CcmH-like mitochondrial protein
Arabidopsis	`AT1G15220` (CCMH) cytochrome c biosis protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838089] identity=63.5; qcov=1.05; evalue=1.24e-67; confidence=high
Rice	`Os02g0275100` (CCMH) - identity=69.6; qcov=0.974; evalue=1.33e-78; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03918 (CcmH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057773096.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057773096.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057773096.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057773096.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773096.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10030011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B10,B69,D7
`Chr7:10030011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B69,D7
`Chr7:10030088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:10030121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B69,D7
`Chr7:10030154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,B99
`Chr7:10030691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B121,C51,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773096.1

152 aa

152

CcmH

PF03918 CcmH 3-114 aa

XP_057773097.1

152 aa

152

CcmH

PF03918 CcmH 3-114 aa

XP_057773099.1

152 aa

152

CcmH

PF03918 CcmH 3-114 aa

XP_057773100.1

152 aa

152

CcmH

PF03918 CcmH 3-114 aa

XP_057773101.1

152 aa

152

CcmH

PF03918 CcmH 3-114 aa

XP_057773102.1

152 aa

152

CcmH

PF03918 CcmH 3-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773096.1`	Pfam	`PF03918`	CcmH	Family	3	114	1.1e-29	103.2	Cytochrome C biogenesis protein
`XP_057773097.1`	Pfam	`PF03918`	CcmH	Family	3	114	1.1e-29	103.2	Cytochrome C biogenesis protein
`XP_057773099.1`	Pfam	`PF03918`	CcmH	Family	3	114	1.1e-29	103.2	Cytochrome C biogenesis protein
`XP_057773100.1`	Pfam	`PF03918`	CcmH	Family	3	114	1.1e-29	103.2	Cytochrome C biogenesis protein
`XP_057773101.1`	Pfam	`PF03918`	CcmH	Family	3	114	1.1e-29	103.2	Cytochrome C biogenesis protein
`XP_057773102.1`	Pfam	`PF03918`	CcmH	Family	3	114	1.1e-29	103.2	Cytochrome C biogenesis protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917118.1
AATATTTTAATTAATTCCTAAATTTGAATCAGGCTCAGGCCTAACAATTCGTCTCCATTCCTCTTCCAAATCTGAACGCGCCGCTCCCAATCTCTCATCTCCTCGGATTCTCGCTCCGGTCGGCGGCGCCGATAGCACGCCGCGACTTAGACCACCCCTTCCCTCCTTCCCCGTTCGCAGTGCACCCGACCAGACGCCGACTCCAGACTCCCCACCGGCGCTTCTCCTTCAAATCTTCAAAGCAGTTGTATTGGGGTGAA...

XM_057917113.1
GCTATAGGTCAGGACCTTTTTGTGAAACGTTGAGAAGTTTATGGTTGAAAGTGTAAATTTTCCCAAATTTAACACACAGAAAACGCGAGTTTCCGCCAGCCACGTTTTAGAATTGAGAACTAAAGCAAAACTCCATTGTTAAACCCTTTCATTGTAATCTTCAGCTCACAACTCTTCAGCCTTCTCCTTTTTCTTGTCGATTTCAGAAGAGATCAAAGAGCAGTTGTATTGGGGTGAAAGGTTCATGGAGAATGAGGATG...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC130992471
ATGGAGAATGAGGATGAAGTGAGAAAGGATCGTGTGGTCGAAGCACGGGCCAGAAATATAAGCCACAATGTGCGGTGCACTGAATGTGGTAGTCAATCTATTGAAGACTCGCAAGCTGACATTGCCATTCTCCTCCGCAAGTTAATACGAGATGAAATTCGGTCTGGTAAAAACGACAAAGAGATCTACAAGAAGCTGGAGGAAGATTTTGGTGAGACGGTGCTTTACACACCAAAATTTGATATACAAACAGCAGCTAT...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057773096.1
MENEDEVRKDRVVEARARNISHNVRCTECGSQSIEDSQADIAILLRKLIRDEIRSGKNDKEIYKKLEEDFGETVLYTPKFDIQTAAIWLAPLTLTGGAVAIWAFNRYRRKNNVHIMALDLVRGVPLTLKERETMLELLTPPSTRWWGKWLPR

XP_057773097.1
MENEDEVRKDRVVEARARNISHNVRCTECGSQSIEDSQADIAILLRKLIRDEIRSGKNDKEIYKKLEEDFGETVLYTPKFDIQTAAIWLAPLTLTGGAVAIWAFNRYRRKNNVHIMALDLVRGVPLTLKERETMLELLTPPSTRWWGKWLPR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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